RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556591.1

CFAP54-208, Transcript of cilia and flagella associated protein 54, human

TSL 5

Gene CFAP54, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP54-208	ENST00000556591	DPP10	Q8N608	796 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	MST1R	Q04912	1400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM247	A6NEH6	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591		H0YGN5	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	STRN	O43815	780 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	TMCC1	O94876	653 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	PRKCH	P24723	683 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	HNF1B	P35680	557 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	CCT5	P48643	541 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	NCSTN	Q92542	709 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	FRG2B	Q96QU4	278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	GDA	Q9Y2T3	454 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CFAP54-208	ENST00000556591	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	PEX12	O00623	359 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	CNTF	P26441	200 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	GJC1	P36383	396 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	POLD2	P49005	469 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	LINC00205	P59089	165 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	TAF12	Q16514	161 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	LPAR1	Q92633	364 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	MYMK	A6NI61	221 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	STMND1	H3BQB6	276 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	TOMM40	O96008	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	POLB	P06746	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	HOXB2	P14652	356 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	SCP2	P22307	547 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	CCR5	P51681	352 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	P2RX3	P56373	397 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	UBE3A	Q05086	875 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591		Q5PR19	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	GORAB	Q5T7V8	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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