RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT39	Q6A163	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ITIH5	Q86UX2	942 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR65	Q8IYL9	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	GCNA	Q96QF7	691 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MYADM	Q96S97	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	KXD1	Q9BQD3	176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ACBD6	Q9BR61	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	RAB20	Q9NX57	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CEP72	Q9P209	647 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CDH9	Q9ULB4	789 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ASB1	Q9Y576	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CLUH	O75153	1309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	EYS	Q5T1H1	3165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CDH23	Q9H251	3354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288		H0Y858	1186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MAPK13	O15264	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	KNG1	P01042	644 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	LAMP2	P13473	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT5	P13647	590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ALAD	P13716	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CD19	P15391	556 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	GABRR2	P28476	465 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	GTF2H1	P32780	548 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	FMO5	P49326	533 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MXI1	P50539	228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	IL2	P60568	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TEAD2	Q15562	447 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	NFIL3	Q16649	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ZACN	Q401N2	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR158	Q5T848	1215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	C12orf29	Q8N999	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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