RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NEU2Q9Y3R4 380 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TTLL3Q9Y4R7 772 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR51B4Q9Y5P0 310 aa8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ESYT3A0FGR9 886 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TBC1D3BA6NDS4 549 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OPHN1O60890 802 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZMPSTE24O75844 475 aa8.67□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLK1P53350 603 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KDSRQ06136 332 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SULT2A1Q06520 285 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC10A7Q0GE19 358 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZBTB17Q13105 803 aa8.67□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRPSAP1Q14558 356 aa8.67□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MBLAC2Q68D91 279 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DUPD1Q68J44 220 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C4orf22Q6V702 233 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C12orf40Q86WS4 652 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AHI1Q8N157 1196 aa8.67□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACDQ96AP0 544 aa8.67□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SNF8Q96H20 258 aa8.67□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RSPH14Q9UHP6 348 aa8.67□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC25A13Q9UJS0 675 aa8.67□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FDFT1P37268 417 aa8.66□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TDGQ13569 410 aa8.66□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRADDQ15628 312 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ELF2Q15723 593 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GEN1Q17RS7 908 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PARP6Q2NL67 630 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACCSLQ4AC99 568 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAXCQ5TGI0 409 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCGF5Q86SE9 256 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADIPOR2Q86V24 386 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TEX26Q8N6G2 289 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CNTD1Q8N815 330 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BBOF1Q8ND07 529 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa8.66□□□□□ -1.02
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