RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, human

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB4-210	ENST00000522344	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	RASSF2	P50749	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	TRAF1	Q13077	416 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	PRKG1	Q13976	671 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	POSTN	Q15063	836 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	TRIL	Q7L0X0	811 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-210	ENST00000522344	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	RGS14	O43566	566 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	LIAS	O43766	372 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	STRN	O43815	780 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	PRKCH	P24723	683 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	AVPR1A	P37288	418 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	PNPLA4	P41247	253 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	PPP3CC	P48454	512 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	PCYT1A	P49585	367 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	PMS2	P54278	862 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	SELENOV	P59797	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ZXDB	P98169	803 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	BIRC2	Q13490	618 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	CEP76	Q8TAP6	659 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	FRG2B	Q96QU4	278 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ICK	Q9UPZ9	632 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	DDAH2	O95865	285 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	LCAT	P04180	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	CBSL	P0DN79	551 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ARSA	P15289	507 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	RXRA	P19793	462 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	CBS	P35520	551 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	CLCNKB	P51801	687 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	GPS2	Q13227	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	DUSP6	Q16828	381 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	CCT6B	Q92526	530 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	MS4A18	H0YCH9	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	HSPB6	O14558	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	SPRY3	O43610	288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	SLC28A2	O43868	658 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CPEB4-210	ENST00000522344	HOXC6	P09630	235 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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