RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 RINT1Q6NUQ1 792 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 DGKHQ86XP1 1220 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKRD44Q8N8A2 993 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 DBF4BQ8NFT6 615 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD101Q93033 1021 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 TIFAQ96CG3 184 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 PKP3Q9Y446 797 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 CEP83Q9Y592 693 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRAC2D3DTV9 90 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSPB6O14558 160 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 NTSR2O95665 410 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 GLP2RO95838 553 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 LDLRP01130 860 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 AFPP02771 609 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLRK1P26718 216 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARL16Q0P5N6 197 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLEKHG6Q3KR16 790 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 GDPD4Q6W3E5 623 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 C9orf139Q6ZV77 190 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 NAGSQ8N159 534 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAB21L3Q8N8X9 362 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 SECTM1Q8WVN6 248 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF566Q969W8 418 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTC17Q96AE7 1141 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 IFT27Q9BW83 186 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAREM1Q9H706 876 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 NFU1Q9UMS0 254 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAI2Q9Y5P3 530 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 C17orf102A2RUQ5 167 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAGEA13PA6NCF6 341 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 HLA-DQA2P01906 255 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATF3P18847 181 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 DGKAP23743 735 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 VEGFCP49767 419 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 MXI1P50539 228 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 PHEXP78562 749 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYBPC2Q14324 1141 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYB5RLQ6IPT4 315 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 C14orf80Q86SX3 495 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 IL17RCQ8NAC3 791 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM163Q8TC26 289 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBXO17Q96EF6 278 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 BICD1Q96G01 975 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBCBQ99426 244 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 GDF15Q99988 308 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 MECRQ9BV79 373 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 LHPPQ9H008 270 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCRT2Q9NQ03 307 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 STARD7Q9NQZ5 370 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC52A1Q9NWF4 448 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 AGAP5A6NIR3 686 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZG16O60844 167 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLDN7O95471 211 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 MMP3P08254 477 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRKCHP24723 683 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 GSTM2P28161 218 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 GLIPR1P48060 266 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLCNKBP51801 687 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 RCAN1P53805 252 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 ERVK11-1P61568 191 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC35G1Q2M3R5 365 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZACNQ401N2 412 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 XKR9Q5GH70 373 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 RHBDF2Q6PJF5 856 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 NRSN1Q8IZ57 195 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 VPS52Q8N1B4 723 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPEM1Q8N4L4 309 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRC8CQ8TDW0 803 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAR1Q8WVX9 515 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 HMGB4Q8WW32 186 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 HDHD5Q9BXW7 423 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM31Q9BZY9 425 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q9N2J8 555 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 NECTIN3Q9NQS3 549 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEL1LQ9UBV2 794 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNTN6Q9UQ52 1028 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM50BQ9Y247 325 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 NFS1Q9Y697 457 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-277P-201ENST00000516272 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms