RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 TAS2R40P59535 323 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 FAM193AP78312 1265 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF234Q14588 700 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 EFHC2Q5JST6 749 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 TMPRSS6Q8IU80 811 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 MAP7D3Q8IWC1 876 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 CPXM2Q8N436 756 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 SORCS1Q8WY21 1168 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 GATA6Q92908 595 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 AZIN2Q96A70 460 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 SIPA1Q96FS4 1042 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 HES6Q96HZ4 224 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 BTN2A3PQ96KV6 586 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 CAMK1GQ96NX5 476 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 HAPLN3Q96S86 360 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 GPR174Q9BXC1 333 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 TKTL2Q9H0I9 626 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 ITM2CQ9NQX7 267 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 KLK13Q9UKR3 277 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 FZD10Q9ULW2 581 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 CLEC4EQ9ULY5 219 aa11.65□□□□□ -0.54
UBE2B-208ENST00000511807 USP24Q9UPU5 2620 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM8BA6NDV4 472 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 KCNU1A8MYU2 1149 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 SH3BP5O60239 455 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 LATS1O95835 1130 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 EPHX1P07099 455 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 RARAP10276 462 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 CD59P13987 128 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 PRKCHP24723 683 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 GJC1P36383 396 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 TPMTP51580 245 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 SCAPQ12770 1279 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 ENPP2Q13822 863 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 PDK2Q15119 407 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 E2F5Q15329 346 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 MPPE1Q53F39 396 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 RAB6CQ53S08 254 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 SYT10Q6XYQ8 523 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 FAM124AQ86V42 546 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 CPNE8Q86YQ8 564 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 RCOR2Q8IZ40 523 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 KCTD6Q8NC69 237 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 C1orf74Q96LT6 269 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 WDR24Q96S15 920 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 TLR10Q9BXR5 811 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 SLC2A11Q9BYW1 496 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 RAB6CQ9H0N0 254 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 OSBPL2Q9H1P3 480 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 AP4E1Q9UPM8 1137 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa11.64□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 MYOFQ9NZM1 2061 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1B0GTW7 788 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 ENC1O14682 589 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 PAGE1O75459 146 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 HLA-EP13747 358 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 PRLRP16471 622 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 TCP1P17987 556 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 IL1R2P27930 398 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 OXTRP30559 389 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 PEX5P50542 639 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 COPS2P61201 443 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 GRIK2Q13002 908 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 SLC14A1Q13336 389 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 KRT81Q14533 505 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 SMTNL2Q2TAL5 461 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 KCNT1Q5JUK3 1230 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 DCAF12L1Q5VU92 463 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC31Q6UY01 552 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 KATNAL2Q8IYT4 538 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC185Q8N715 623 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 CADM4Q8NFZ8 388 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 EXD1Q8NHP7 514 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 KIF18AQ8NI77 898 aa11.63□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 HSPH1Q92598 858 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.5 ms