RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504263.1

PCAT4-201, prostate cancer associated transcript 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT4, Length 2,091 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF487B1APH4 448 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ANKRD63C9JTQ0 380 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 H0Y858 1186 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ERVH48-1M5A8F1 160 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TOR1AO14656 332 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 RAD17O75943 681 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SEC14L2O76054 403 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 NDST3O95803 873 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 IFNA16P05015 189 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 GSNP06396 782 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 COL6A1P12109 1028 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ACTN1P12814 892 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ICAM2P13598 275 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 CHRNB2P17787 502 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 CD247P20963 164 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 PROZP22891 400 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SHMT1P34896 483 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 KRT20P35900 424 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 UGT2B10P36537 528 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 DDOSTP39656 456 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 NR4A2P43354 598 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 NR2C2P49116 596 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 NDST1P52848 882 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 GALCP54803 685 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 AP1S2P56377 157 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 JAM2P57087 298 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 COPZ1P61923 177 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 UBXN2AP68543 259 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 RHAGQ02094 409 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 GNA12Q03113 381 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SLC18A2Q05940 514 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SCRN3Q0VDG4 424 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TFCP2Q12800 502 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 CBLBQ13191 982 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 AP3B2Q13367 1082 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 IKBKEQ14164 716 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 GCKRQ14397 625 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 GK3PQ14409 553 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 RAB39AQ14964 217 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TSC22D1Q15714 1073 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 NPY5RQ15761 445 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF181Q2M3W8 571 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 LETM2Q2VYF4 491 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 FSCBQ5H9T9 825 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TMEM67Q5HYA8 995 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 C6orf52Q5T4I8 152 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 AGAP6Q5VW22 663 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 RFX8Q6ZV50 586 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 WDR49Q8IV35 697 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 UNC45BQ8IWX7 931 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 CDH26Q8IXH8 852 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 CLIP4Q8N3C7 705 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SLC25A41Q8N5S1 370 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 KIAA1958Q8N8K9 716 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 KIAA0895Q8NCT3 520 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 BEST2Q8NFU1 509 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ABHD11Q8NFV4 315 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 PJA1Q8NG27 643 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 OR7D4Q8NG98 312 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 OR6F1Q8NGZ6 308 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SLC35G2Q8TBE7 412 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 MZB1Q8WU39 189 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 STON2Q8WXE9 905 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SEPT1Q8WYJ6 367 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ALG3Q92685 438 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TFAP2CQ92754 450 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 CD101Q93033 1021 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TOP1MTQ969P6 601 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SGK3Q96BR1 496 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 AGAP4Q96P64 663 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SORT1Q99523 831 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SYT11Q9BT88 431 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SLC13A1Q9BZW2 595 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ADAMTS10Q9H324 1103 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 NARFLQ9H6Q4 476 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ACAD9Q9H845 621 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TIGARQ9NQ88 270 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 HOMER2Q9NSB8 354 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 FBXO28Q9NVF7 368 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SYBUQ9NX95 663 aa3.58□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 MCM9Q9NXL9 1143 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms