RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 MTRRQ9UBK8 725 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SOX13Q9UN79 622 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PLLPQ9Y342 182 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 WDR91A4D1P6 747 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ANXA9O76027 345 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TBX18O95935 607 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 GSTA1P08263 222 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ATF6P18850 670 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CRHR1P34998 444 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ANO4Q32M45 955 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 USP41Q3LFD5 358 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 C10orf120Q5SQS8 335 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 OTOAQ7RTW8 1153 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RASSF3Q86WH2 238 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CPNE1Q99829 537 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 GDF15Q99988 308 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CWH43Q9H720 699 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 HAUS2Q9NVX0 235 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SLC17A6Q9P2U8 582 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PSAT1Q9Y617 370 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA1671Q9BY89 1806 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SLC38A8A6NNN8 435 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ZBBXA8MT70 800 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 KLF11O14901 512 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ATP9BO43861 1147 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 IL1BP01584 269 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 HLA-DQB2P05538 268 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ERVK-10P10266 1014 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 GP5P40197 560 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SCTRP47872 440 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SERPINB4P48594 390 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 GEMP55040 296 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MTA1Q13330 715 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CES3Q6UWW8 571 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MIB1Q86YT6 1006 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFAF2Q8N183 169 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA22Q8NHS9 363 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PTPRN2Q92932 1015 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RMDN2Q96LZ7 410 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 UBP1Q9NZI7 540 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 BACE2Q9Y5Z0 518 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 OBSL1O75147 1896 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SLC12A8A0AV02 714 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 DRGXA6NNA5 263 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ADAM12O43184 909 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TLR5O60602 858 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CNTN5O94779 1100 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 UPP2O95045 317 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PEX11BO96011 259 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ITGA2BP08514 1039 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ADRA1AP35348 466 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ALFQ53S48 1182 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 STXBP5Q5T5C0 1151 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 GRTP1Q5TC63 336 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RAP1GAP2Q684P5 730 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 FBXL22Q6P050 247 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 GIPC2Q8TF65 315 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ISL2Q96A47 359 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MFSD3Q96ES6 412 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 IGSF21Q96ID5 467 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 APOL2Q9BQE5 337 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 KIFC1Q9BW19 673 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 VN1R3Q9BXE9 311 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SLC13A1Q9BZW2 595 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF212Q9UDV6 495 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CAPN7Q9Y6W3 813 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 DENND4CQ5VZ89 1909 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 EFCAB14O75071 495 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 BAIAP3O94812 1187 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SHHQ15465 462 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 GALNTL6Q49A17 601 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 C9orf50Q5SZB4 431 aa8.34□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms