RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494664.5

TIMMDC1-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMMDC1, Length 2,394 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-208ENST00000494664 FAM47EQ6ZV65 393 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 FAM131BQ86XD5 332 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 TTC8Q8TAM2 541 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 LRRC3BQ96PB8 259 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 TUBB6Q9BUF5 446 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRIM62Q9BVG3 475 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 STAP1Q9ULZ2 295 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 PHTF1Q9UMS5 762 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 USTQ9Y2C2 406 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 HELZP42694 1942 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC12A8A0AV02 714 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 MAP3K13O43283 966 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 CREB3O43889 395 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ENTPD5O75356 428 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 PROSCO94903 275 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 IRF1P10914 325 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 FOXN2P32314 431 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 AVPR1AP37288 418 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 RANBP1P43487 201 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 GSTA3Q16772 222 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 RGS9BPQ6ZS82 235 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLCO2A1Q92959 643 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 PEBP4Q96S96 227 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC28BQ9BUN5 200 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 IP6K2Q9UHH9 426 aa12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ENDOD1O94919 500 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 T-ENOLP0DO92 83 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 FCARP24071 287 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 IL1R2P27930 398 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 VIPR2P41587 438 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 TAS2R40P59535 323 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC7A9P82251 487 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 STAT4Q14765 748 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 AADACL2Q6P093 401 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF449Q6P9G9 518 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC185Q8N715 623 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 NIPA2Q8N8Q9 360 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 PTPRN2Q92932 1015 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC39A13Q96H72 371 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ASB16Q96NS5 453 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 NECTIN4Q96NY8 510 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SERPINB11Q96P15 392 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 MAGEB5Q9BZ81 275 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 LRRC19Q9H756 370 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 PCMTD2Q9NV79 361 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 CDH7Q9ULB5 785 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 GREM1O60565 184 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 IGLV3-27P01718 113 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 KLKB1P03952 638 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 MIPP30301 263 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 DEUP1Q05D60 604 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPARCL1Q14515 664 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 LEXMQ3ZCV2 418 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC45A4Q5BKX6 768 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 STRADAQ7RTN6 431 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 UCMAQ8WVF2 138 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SNF8Q96H20 258 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 PCSK1NQ9UHG2 260 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 TLR6Q9Y2C9 796 aa12.12□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 STC2O76061 302 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 TJP3O95049 919 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZWINTO95229 277 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 PYGLP06737 847 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 LAMP2P13473 410 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 IL9P15248 144 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 COMTP21964 271 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 MAN1A1P33908 653 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 CXCR3P49682 368 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC18A1P54219 525 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC34A1Q06495 639 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 RHBDF2Q6PJF5 856 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ATL2Q8NHH9 583 aa12.11□□□□□ -0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRT35Q92764 455 aa12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms