RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493715.1

CHTF18-212, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 691 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-212ENST00000493715 CDR2Q01850 454 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 RHDQ02161 417 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 ILKQ13418 452 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 BROXQ5VW32 411 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF677Q86XU0 584 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 EID2Q8N6I1 236 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 GANCQ8TET4 914 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 SLC6A18Q96N87 628 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 SPAG5Q96R06 1193 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 SIK2Q9H0K1 926 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 CLMPQ9H6B4 373 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 GDF3Q9NR23 364 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 PLXNA2O75051 1894 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 ITIH6Q6UXX5 1313 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 KNTC1P50748 2209 aa14.07□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 A0A1W2PPC4 97 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 CNTN5O94779 1100 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 IGHV4-34P06331 123 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 ATP1A3P13637 1013 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 GLDCP23378 1020 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF165P49910 485 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 UCNP55089 124 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 UBXN1Q04323 297 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 DEUP1Q05D60 604 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 SLC25A52Q3SY17 297 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 C5orf22Q49AR2 442 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 BRMS1LQ5PSV4 323 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 PCSK4Q6UW60 755 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 BNIPLQ7Z465 357 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 EMC1Q8N766 993 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 KDM1BQ8NB78 822 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 MSANTD4Q8NCY6 345 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 NEK11Q8NG66 645 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 SLC30A5Q8TAD4 765 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 SAP25Q8TEE9 199 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 ALG14Q96F25 216 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 WBP1Q96G27 269 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 PCDHB18PQ96TA0 734 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 C11orf70Q9BRQ4 267 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 ORAI3Q9BRQ5 295 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 TSPY26PQ9H489 355 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 WDCPQ9H6R7 721 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 SCML1Q9UN30 329 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.06□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 MYLKQ15746 1914 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 GJB6O95452 261 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 VAV1P15498 845 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 CD38P28907 300 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 STAT1P42224 750 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 PLK1P53350 603 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 TMPRSS3P57727 454 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 SLC12A1Q13621 1099 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 ARID5BQ14865 1188 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 RAB6CQ53S08 254 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 ALFQ53S48 1182 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 SLC45A4Q5BKX6 768 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 ARTNQ5T4W7 220 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 USP30Q70CQ3 517 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 TSC1Q92574 1164 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 PTPRN2Q92932 1015 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 SERGEFQ9UGK8 458 aa14.05□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 A0A1W2PP55 124 aa14.04□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 LRRC72A6NJI9 287 aa14.04□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 MID1O15344 667 aa14.04□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 ARHGAP6O43182 974 aa14.04□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 CLDN11O75508 207 aa14.04□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 F9P00740 461 aa14.04□□□□□ -0.16
CHTF18-212ENST00000493715 UNGP13051 313 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms