RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 GUCY1B2O75343 617 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ERCC2P18074 760 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ADRA1DP25100 572 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 STXBP5Q5T5C0 1151 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 FBXO10Q9UK96 956 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 SNX13Q9Y5W8 968 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 TLR5O60602 858 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ACMSDQ8TDX5 336 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 EFR3BQ9Y2G0 817 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 M0R3G1 203 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 SEC22BO75396 215 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 UBE2E3Q969T4 207 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 MAML3Q96JK9 1138 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 POMKQ9H5K3 350 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 FBXL21Q9UKT6 434 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CALCAP01258 141 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ANXA5P08758 320 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 KRT20P35900 424 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 RAD23AP54725 363 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 WASHC2DQ5SRD0 308 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 NECAB2Q7Z6G3 386 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 MIER2Q8N344 545 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 OMDQ99983 421 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 HGH1Q9BTY7 390 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 RAD21L1Q9H4I0 556 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 SAR1AQ9NR31 198 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ARL15Q9NXU5 204 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 SH3BP4Q9P0V3 963 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 BTBD7Q9P203 1132 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 RASSF9O75901 435 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 PBX1P40424 430 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 RD3Q7Z3Z2 195 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 C10orf53Q8N6V4 93 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ANKRD27Q96NW4 1050 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ASB8Q9H765 288 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 TMEM191CA6NGB0 347 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 FCHO1O14526 889 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 GOT1P17174 413 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 TRPC1P48995 793 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 GLUD2P49448 558 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CLK2P49760 499 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 NEK2P51955 445 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 THOP1P52888 689 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 PRELID2Q8N945 189 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CLEC4DQ8WXI8 215 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CRYL1Q9Y2S2 319 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 WNT7AO00755 349 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 C12orf29Q8N999 325 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ART4Q93070 314 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CATSPER2Q96P56 530 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 SEMA3CQ99985 751 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ARHGEF9O43307 516 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ATAD3BQ5T9A4 648 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 PHACTR1Q9C0D0 580 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 KCNK4Q9NYG8 393 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 SORCS3Q9UPU3 1222 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 MMP8P22894 467 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 BRCC3P46736 316 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 FAXDC2Q96IV6 333 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 SLC25A23Q9BV35 468 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 TLL1O43897 1013 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CILPO75339 1184 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ZNF682O95780 498 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 GLUD1P00367 558 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 HTR7P34969 479 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 FAM46CQ5VWP2 391 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 WDR47O94967 919 aa17.27■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 CXCL14O95715 111 aa17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms