RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FAM124A	Q86V42	546 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	UNC93A	Q86WB7	457 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	MDM1	Q8TC05	714 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	NKD1	Q969G9	470 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	IGSF8	Q969P0	613 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	NXPE2	Q96DL1	559 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	RHOV	Q96L33	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ACOX2	Q99424	681 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FBRS	Q9HAH7	460 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SCML2	Q9UQR0	700 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	MYH10	P35580	1976 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388		A0A087WV48	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388		A0A1B0GVT2	93 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	WASH3P	C4AMC7	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PSPN	O60542	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TBX18	O95935	607 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	DNTT	P04053	509 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CAPNS1	P04632	268 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	C1S	P09871	688 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	RARG	P13631	454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ABCB4	P21439	1286 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	BMP6	P22004	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	KIR3DL1	P43629	444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CCT8	P50990	548 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF445	P59923	1031 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CACUL1	Q86Y37	369 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	MIB1	Q86YT6	1006 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	GANC	Q8TET4	914 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TAF4B	Q92750	862 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CLIC6	Q96NY7	704 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TRIM9	Q9C026	710 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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