RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD48P09326 243 aa16.82■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLD1Q13393 1074 aa16.82■□□□□ 0.28
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf127Q8N9H9 656 aa16.82■□□□□ 0.28
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC35G1Q2M3R5 365 aa16.81■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MILR1Q7Z6M3 343 aa16.81■□□□□ 0.28
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CASP10Q92851 521 aa16.81■□□□□ 0.28
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa16.81■□□□□ 0.28
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC1A5Q15758 541 aa16.81■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HERC6Q8IVU3 1022 aa16.81■□□□□ 0.28
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CERCAMQ5T4B2 595 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL27RAQ6UWB1 636 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TFAP2BQ92481 460 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USE1Q9NZ43 259 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAD51BO15315 384 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSMCR30P0CW71 290 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAF5Q15542 800 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAGED4Q96JG8 741 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC25A23Q9BV35 468 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PALMDQ9NP74 551 aa16.8■□□□□ 0.28
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