RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 ATL3Q6DD88 541 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 AHI1Q8N157 1196 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 TTC17Q96AE7 1141 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PP55 124 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PPC4 97 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PR77 199 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 VILLO15195 856 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 MID1O15344 667 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 C1QL1O75973 258 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 LATS1O95835 1130 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 DNTTP04053 509 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 MYL1P05976 194 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 FYNP06241 537 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 LCP1P13796 627 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 SYKP43405 635 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 METAP1P53582 386 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 BCAT1P54687 386 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 RPS24P62847 133 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ZBTB16Q05516 673 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 DNAJC3Q13217 504 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CUL2Q13617 745 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 SGO2Q562F6 1265 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 PMF1Q6P1K2 205 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 BEND4Q6ZU67 534 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 RNF139Q8WU17 664 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 KAT5Q92993 513 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 FAM129BQ96TA1 746 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 RBSNQ9H1K0 784 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC4Q9HBW1 653 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 SGK2Q9HBY8 427 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 STIM2Q9P246 746 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 USP25Q9UHP3 1055 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CFAP45Q9UL16 551 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 COQ4Q9Y3A0 265 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ASXL3Q9C0F0 2248 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 FAM47DPA6NHR8 397 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 TTC34A8MYJ7 566 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ENC1O14682 589 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ACSL4O60488 711 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 VDRP11473 427 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CD19P15391 556 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CSKP41240 450 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 PREPP48147 710 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 NUMBP49757 651 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 LRMPQ12912 555 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 BNIP3Q12983 259 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 E2F5Q15329 346 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 MPP7Q5T2T1 576 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 SCML4Q8N228 414 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 AADATQ8N5Z0 425 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 FIBINQ8TAL6 211 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 SAP25Q8TEE9 199 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 SLC35F5Q8WV83 523 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 FBRSQ9HAH7 460 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CNGB3Q9NQW8 809 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ABCC13Q9NSE7 274 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 FBXL12Q9NXK8 326 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 SUN2Q9UH99 717 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms