RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 DENRO43583 198 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 HSPA4LO95757 839 aa24.99■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 SLC10A3P09131 477 aa24.99■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 GMPRP36959 345 aa24.99■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 MAGEA12P43365 314 aa24.99■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 LGMNQ99538 433 aa24.99■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 TRPV2Q9Y5S1 764 aa24.99■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 TSC2P49815 1807 aa24.99■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 M0QYT0 321 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 PDLIM1O00151 329 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 SMIM18P0DKX4 95 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 ERVK-10P10266 1014 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 NUMBP49757 651 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 TKTL1P51854 596 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 CRHR2Q13324 411 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 GNASQ5JWF2 1037 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 BSPRYQ5W0U4 402 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 HFE2Q6ZVN8 426 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 CMC1Q7Z7K0 106 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 CERS2Q96G23 380 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 SLC2A13Q96QE2 648 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 STK39Q9UEW8 545 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 ADAM28Q9UKQ2 775 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 STAP1Q9ULZ2 295 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 MFSD11O43934 449 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 POLBP06746 335 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 FAM200BP0CF97 657 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 TLR1Q15399 786 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 DCLK2Q8N568 766 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 RNF139Q8WU17 664 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 DCUN1D1Q96GG9 259 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 MIOSQ9NXC5 875 aa24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 ATP9BO43861 1147 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 STK10O94804 968 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 RABGGTBP53611 331 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 TNS4Q8IZW8 715 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 WNT8BQ93098 351 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 E2F8A0AVK6 867 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM114B3SHH9 223 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 RNF103O00237 685 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 NRP1O14786 923 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 FBXO21O94952 628 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 THP07101 528 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 GLDCP23378 1020 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 CLCNKBP51801 687 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 NME3Q13232 169 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 MAP7Q14244 749 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 SPANXN3Q5MJ09 141 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 NAPRTQ6XQN6 538 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 NETO2Q8NC67 525 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 MAPK15Q8TD08 544 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 LPPQ93052 612 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 SERPINI1Q99574 410 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 PIGVQ9NUD9 493 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 KPNA6O60684 536 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 OR6B1O95007 311 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 PGM3O95394 542 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 CTSHP09668 335 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 YY1P25490 414 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 SERPINB8P50452 374 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 RBBP8Q99708 897 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 ULBP1Q9BZM6 244 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 Q9H521 79 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 TCF7L2Q9NQB0 619 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 CHRNA1P02708 482 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 FYNP06241 537 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 THRAP10827 490 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 PSMB4P28070 264 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 LHX1P48742 406 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 CES3Q6UWW8 571 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM86AQ8N2M4 240 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 PGBD4Q96DM1 585 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 P2RY11Q96G91 374 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 CLIC5Q9NZA1 410 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 HTTP42858 3142 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-206ENST00000414253 MYBPHLA2RUH7 354 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-206ENST00000414253 G3V2L1 256 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-206ENST00000414253 CREB3O43889 395 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-206ENST00000414253 SPRP35270 261 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-206ENST00000414253 ARMC3Q5W041 872 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-206ENST00000414253 C16orf89Q6UX73 402 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-206ENST00000414253 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms