RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 GPR182O15218 404 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 IGLV3-25P01717 112 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 AKR1A1P14550 325 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC25A3Q00325 362 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 LBRQ14739 615 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 DLG2Q15700 870 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 ZYG11AQ6WRX3 759 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 LZTR1Q8N653 840 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 CNTD1Q8N815 330 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 ACTRT2Q8TDY3 377 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 FCRL5Q96RD9 977 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 HAPLN3Q96S86 360 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 TBL1YQ9BQ87 522 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 NDE1Q9NXR1 346 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC39A10Q9ULF5 831 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 IGHA2P01877 340 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 COL6A2P12110 1019 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 PKN3Q6P5Z2 889 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 NAPRTQ6XQN6 538 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF781Q8N8C0 355 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 BDNFP23560 247 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 BTKQ06187 659 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 GRM3Q14832 879 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 PGM2L1Q6PCE3 622 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 ATPAF2Q8N5M1 289 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 POU5F2Q8N7G0 328 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 STON2Q8WXE9 905 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 UBP1Q9NZI7 540 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 CABYRO75952 493 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 CELF2O95319 508 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 PDHA1P08559 390 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 RAB27AP51159 221 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 RAPH1Q70E73 1250 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 OTOP3Q7RTS5 596 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 SOCS4Q8WXH5 440 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 IL12RB2Q99665 862 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 RAP2CQ9Y3L5 183 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 CHRNA1P02708 482 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 HOXC13P31276 330 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 ABCG1P45844 678 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 NUMBP49757 651 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 USP4Q13107 963 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 CNTN4Q8IWV2 1026 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 JADE3Q92613 823 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 PKMYT1Q99640 499 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 TASP1Q9H6P5 420 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 GLOD4Q9HC38 313 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 NEU3Q9UQ49 428 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 DFFAO00273 331 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF623O75123 536 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 GEMP55040 296 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC12A1Q13621 1099 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 USP10Q14694 798 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 LIPMQ5VYY2 423 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 SPDL1Q96EA4 605 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 PAAF1Q9BRP4 392 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 DRC3Q9H069 523 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 VCXQ9H320 206 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 IRAK2O43187 625 aa23.45■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 COX4I1P13073 169 aa23.45■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 PSEN1P49768 467 aa23.45■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa23.45■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 USP33Q8TEY7 942 aa23.45■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 S100A14Q9HCY8 104 aa23.45■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 ABCC13Q9NSE7 274 aa23.45■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa23.45■■□□□ 1.35
RABGGTA-202ENST00000399409 SHROOM3Q8TF72 1996 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-202ENST00000399409 M0QZQ0 153 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-202ENST00000399409 MATN3O15232 486 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-202ENST00000399409 KLF10Q13118 480 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-202ENST00000399409 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms