RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 COMMD8Q9NX08 183 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-202ENST00000392011 BTBD7Q9P203 1132 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-202ENST00000392011 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 CLK2P49760 499 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 IL27RAQ6UWB1 636 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 SERAC1Q96JX3 654 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 DUSP16Q9BY84 665 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM105AQ9NUU6 356 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 TRPC4Q9UBN4 977 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 LIMD1Q9UGP4 676 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 NOMO2Q5JPE7 1267 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 HECTD3Q5T447 861 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 SPPL2AQ8TCT8 520 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR152Q8TDT2 470 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 USE1Q9NZ43 259 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 GSTM1P09488 218 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 TFEBP19484 476 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP17.45■□□□□ 0.384e-9■■■■■ 51.6
SH3BP4-202ENST00000392011 STK32CQ86UX6 486 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 LHX5Q9H2C1 402 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 RGS5O15539 181 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 DUSP28Q4G0W2 176 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 C9orf57Q5W0N0 161 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA2013Q8IYS2 634 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 MECRQ9BV79 373 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 ZYG11BQ9C0D3 744 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 ARL15Q9NXU5 204 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 MPP6Q9NZW5 540 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 OR56A5P0C7T3 313 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 VCLP18206 1134 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 RRM2P31350 389 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 CCL23P55773 120 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 STAG3L4Q8TBR4 150 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 TRPC4APQ8TEL6 797 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 BCAS3Q9H6U6 928 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 CNGB3Q9NQW8 809 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 SNX8Q9Y5X2 465 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A087X1B8 175 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 LDLRP01130 860 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM58BPP0C7Q3 252 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 ABL2P42684 1182 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 GRIA4P48058 902 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 HSPA14Q0VDF9 509 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 CMC1Q7Z7K0 106 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 AGAP11Q8TF27 550 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 MAGED4Q96JG8 741 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 SYBUQ9NX95 663 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 OPTCQ9UBM4 332 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 FBXO5Q9UKT4 447 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 IPPQ9Y573 584 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 LRCH4O75427 683 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 LCA5LO95447 670 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 HDCP19113 662 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 C1orf127Q8N9H9 656 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 TBCDQ9BTW9 1192 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 CLOCKO15516 846 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 ENTPD5O75356 428 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 IL5RAQ01344 420 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 ADRM1Q16186 407 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 DENND1CQ8IV53 801 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 PPTC7Q8NI37 304 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 PEX11AO75192 247 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 GBE1Q04446 702 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 ACOX1Q15067 660 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 LCLAT1Q6UWP7 414 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM69Q86WT6 500 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 CLEC4DQ8WXI8 215 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFP42Q96MM3 310 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 PANX3Q96QZ0 392 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 BDH2Q9BUT1 245 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 BPIFA1Q9NP55 256 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 MORF4L1Q9UBU8 362 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR25O00155 361 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 IMPDH2P12268 514 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 TYMPP19971 482 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 CRY1Q16526 586 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 RD3Q7Z3Z2 195 aa17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms