RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 CHMP4AQ9BY43 222 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-202ENST00000367364 YY1AP1Q9H869 796 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-202ENST00000367364 TOP2BQ02880 1626 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-202ENST00000367364 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC18Q5T9S5 1454 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-202ENST00000367364 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-202ENST00000367364 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-202ENST00000367364 SMARCA4P51532 1647 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-202ENST00000367364 CLCA1A8K7I4 914 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 KIF3BO15066 747 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 THAP12O43422 761 aa4.15□□□□□ -1.75
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PTPRC-202ENST00000367364 KLRC2P26717 231 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 STAT1P42224 750 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 RAB27AP51159 221 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 ADPRHP54922 357 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 RHAGQ02094 409 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 DLG1Q12959 904 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa4.15□□□□□ -1.75
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PTPRC-202ENST00000367364 TMEM217Q8N7C4 229 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 ANKRD44Q8N8A2 993 aa4.15□□□□□ -1.75
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PTPRC-202ENST00000367364 NEK9Q8TD19 979 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 PANK2Q9BZ23 570 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 CDH19Q9H159 772 aa4.15□□□□□ -1.75
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PTPRC-202ENST00000367364 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 FSCN3Q9NQT6 498 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 MIA2Q96PC5 1412 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 MCIDASD6RGH6 385 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 CLGNO14967 610 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 EXTL3O43909 919 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 PEPDP12955 493 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 PHEXP78562 749 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
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PTPRC-202ENST00000367364 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 ZSCAN30Q86W11 494 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 CEP76Q8TAP6 659 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 LRRC8CQ8TDW0 803 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 SLC35F5Q8WV83 523 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 IQCDQ96DY2 449 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 FAR2Q96K12 515 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF696Q9H7X3 374 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 FAM204AQ9H8W3 233 aa4.14□□□□□ -1.75
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PTPRC-202ENST00000367364 M0QYT0 321 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 GOLIM4O00461 696 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 AREL1O15033 823 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 NKX2-8O15522 239 aa4.13□□□□□ -1.75
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PTPRC-202ENST00000367364 TAS2R50P59544 299 aa4.13□□□□□ -1.75
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PTPRC-202ENST00000367364 GDPD4Q6W3E5 623 aa4.13□□□□□ -1.75
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PTPRC-202ENST00000367364 TMEM163Q8TC26 289 aa4.13□□□□□ -1.75
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PTPRC-202ENST00000367364 GRPEL1Q9HAV7 217 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 C1orf112Q9NSG2 853 aa4.13□□□□□ -1.75
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PTPRC-202ENST00000367364 MXI1P50539 228 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPRC-202ENST00000367364 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
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PTPRC-202ENST00000367364 MYH16Q9H6N6 1097 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 UBTD1Q9HAC8 227 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 RAD50Q92878 1312 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-202ENST00000367364 MBD5Q9P267 1494 aa4.11□□□□□ -1.75
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