RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358572.9

TMA16-201, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMA16, Length 1,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16-201ENST00000358572 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ZNF840PA6NDX5 716 aa15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 GP5P40197 560 aa15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 KCNQ1P51787 676 aa15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 GEMP55040 296 aa15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 DSG1Q02413 1049 aa15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 TNK2Q07912 1038 aa15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 C5orf22Q49AR2 442 aa15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 RNF43Q68DV7 783 aa15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 OTOAQ7RTW8 1153 aa15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 RASSF3Q86WH2 238 aa15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 NDUFAF2Q8N183 169 aa15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 SLC39A11Q8N1S5 342 aa15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 CCDC63Q8NA47 563 aa15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 PDZD8Q8NEN9 1154 aa15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 MYEOVQ96EZ4 313 aa15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 MYRFLQ96LU7 910 aa15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 SLC13A1Q9BZW2 595 aa15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ABCF3Q9NUQ8 709 aa15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 DNMT3LQ9UJW3 386 aa15.94■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 J3KR12 359 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 C2CD2LO14523 706 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ITGA2BP08514 1039 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 CLTBP09497 229 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 LIG3P49916 1009 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 RENBPP51606 427 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 GRTP1Q5TC63 336 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 TPGS2Q68CL5 300 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 KLHDC10Q6PID8 442 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 RANBP10Q6VN20 620 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 TEX26Q8N6G2 289 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 IPMKQ8NFU5 416 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ZNF333Q96JL9 665 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 SLC25A51Q9H1U9 297 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 PCMTD2Q9NV79 361 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 NMBRP28336 390 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 STXBP5Q5T5C0 1151 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 C10orf67Q8IYJ2 551 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 MRGPRX2Q96LB1 330 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ZNF558Q96NG5 402 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 MCMBPQ9BTE3 642 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 KLHL14Q9P2G3 628 aa15.93■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 DOCK4Q8N1I0 1966 aa15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 TPP1O14773 563 aa15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 KLF11O14901 512 aa15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 TACR2P21452 398 aa15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 SLC10A7Q0GE19 358 aa15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 PARP15Q460N3 678 aa15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 GALNTL6Q49A17 601 aa15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 PCID2Q5JVF3 399 aa15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 PKN3Q6P5Z2 889 aa15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 KDELC1Q6UW63 502 aa15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 PSMG2Q969U7 264 aa15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ISL2Q96A47 359 aa15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 RMDN2Q96LZ7 410 aa15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ZNF778Q96MU6 729 aa15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 AGAP2Q99490 1192 aa15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 FICDQ9BVA6 458 aa15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 HAUS2Q9NVX0 235 aa15.92■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 IL1BP01584 269 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ITGB8P26012 769 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 MAGEA12P43365 314 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 SCTRP47872 440 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 MAPKAPK2P49137 400 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 DEFB103AP81534 67 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 MPP3Q13368 585 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 HECTD3Q5T447 861 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 MARC1Q5VT66 337 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ARMC2Q8NEN0 867 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 RBBP8Q99708 897 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ATP13A1Q9HD20 1204 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 WBP1LQ9NX94 342 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 SIRPGQ9P1W8 387 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 TXNDC16Q9P2K2 825 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 SLC12A4Q9UP95 1085 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 LTBP2Q14767 1821 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 COCHO43405 550 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ACSL4O60488 711 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 RAMP2O60895 175 aa15.91■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 PMPCBO75439 489 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms