RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 SCYL1Q96KG9 808 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PANX2Q96RD6 677 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TSSK1BQ9BXA7 367 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CYP4F12Q9HCS2 524 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 VPS45Q9NRW7 570 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CHST7Q9NS84 486 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GDAP2Q9NXN4 497 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CAPN11Q9UMQ6 739 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MYH11P35749 1972 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PQU0 124 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM23A6NLE4 172 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 KCNU1A8MYU2 1149 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 KCNK1O00180 336 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 O00370 1275 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CPP00450 1065 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GSTA1P08263 222 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GSTA2P09210 222 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 EPB42P16452 691 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 JUNDP17535 347 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CHRM3P20309 590 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CD6P30203 668 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CHRNA3P32297 505 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CLCN1P35523 988 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CCT8P50990 548 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 DAOAP59103 153 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TMTC4Q5T4D3 741 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PMF1Q6P1K2 205 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SLC30A9Q6PML9 568 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TAC4Q86UU9 113 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GALNT13Q8IUC8 556 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RASGRP3Q8IV61 690 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 VPS50Q96JG6 964 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ZSWIM3Q96MP5 696 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TBCBQ99426 244 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 KCNF1Q9H3M0 494 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MTG2Q9H4K7 406 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SEMA4GQ9NTN9 838 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TXLNGQ9NUQ3 528 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RP1P56715 2156 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 A6NCN8 305 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 KCNN4O15554 427 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM16O95361 564 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ESRRBO95718 433 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MMP13P45452 471 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MAXP61244 160 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GNA12Q03113 381 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 KCNMA1Q12791 1236 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PTK2BQ14289 1009 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 DUOXA1Q1HG43 343 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 BBS9Q3SYG4 887 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 C6orf163Q5TEZ5 329 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 IL27RAQ6UWB1 636 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FRA10AC1Q70Z53 315 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CYP4X1Q8N118 509 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM130Q8N3G9 435 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CAMKK1Q8N5S9 505 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RNF31Q96EP0 1072 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 KRT12Q99456 494 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SMOQ99835 787 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CEP41Q9BYV8 373 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TMLHEQ9NVH6 421 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MID1O15344 667 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SNAP91O60641 907 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CST8O60676 142 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CDK14O94921 469 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 THEGLP0DJG4 465 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ALAS2P22557 587 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SATB1Q01826 763 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PPM1JQ5JR12 505 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 BRMS1LQ5PSV4 323 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 LCLAT1Q6UWP7 414 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf96Q7Z7L8 435 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TTC13Q8NBP0 860 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 OR2T3Q8NH03 318 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 IFT81Q8WYA0 676 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 NCSTNQ92542 709 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RAPGEF5Q92565 580 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 AP2M1Q96CW1 435 aa4.52□□□□□ -1.69
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