RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 AZIN2Q96A70 460 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 WWP1Q9H0M0 922 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 IL37Q9NZH6 218 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM216Q9P0N5 145 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ENPP3O14638 875 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 KITP10721 976 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 KCNA4P22459 653 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 YWHAQP27348 245 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PCLAFQ15004 111 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 HTTP42858 3142 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 A8MUI8 341 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PRKCGP05129 697 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 HLA-DQB2P05538 268 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 KRT72Q14CN4 511 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 FBXO32Q969P5 355 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 NSL1Q96IY1 281 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 FICDQ9BVA6 458 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 DONSONQ9NYP3 566 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 FAM92AA1XBS5 289 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 FCHO1O14526 889 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ALDH2P05091 517 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 SERPINE1P05121 402 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 AQP5P55064 265 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 EFEMP1Q12805 493 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 GPR152Q8TDT2 470 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF778Q96MU6 729 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 CASD1Q96PB1 797 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 SIKE1Q9BRV8 207 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 MCMBPQ9BTE3 642 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ARL8BQ9NVJ2 186 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 COPG2Q9UBF2 871 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 TTC3P53804 2025 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 NBNO60934 754 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 GNRH1P01148 92 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 RHOQP17081 205 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 GRK2P25098 689 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 HADHAP40939 763 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 SLC1A6P48664 564 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 CDK7P50613 346 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ARPP19P56211 112 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 MS4A13Q5J8X5 152 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 FAM91A1Q658Y4 838 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 DENND5AQ6IQ26 1287 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 LONP2Q86WA8 852 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 C10orf107Q8IVU9 208 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 FSD1LQ9BXM9 530 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ZYG11BQ9C0D3 744 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PLXNA3P51805 1871 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 BRCA2P51587 3418 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 A0A096LPK6 155 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC22O60826 627 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 CPB1P15086 417 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 FGFR3P22607 806 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ADRA1AP35348 466 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 NDST2P52849 883 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 BFSP2Q13515 415 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 POTEHQ6S545 545 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF683Q8IZ20 524 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 VPS39Q96JC1 886 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 B3GALT6Q96L58 329 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 NMUR2Q9GZQ4 415 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PHF24Q9UPV7 400 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 E2F8A0AVK6 867 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 GOLGA8TH3BQL2 631 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 F7P08709 466 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 CALB2P22676 271 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PSEN1P49768 467 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 POU6F1Q14863 301 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-201ENST00000323374 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms