RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 CAPN12Q6ZSI9 719 aa16.65■□□□□ 0.26
CHTF18-202ENST00000317063 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa16.65■□□□□ 0.26
CHTF18-202ENST00000317063 C9orf72Q96LT7 481 aa16.65■□□□□ 0.26
CHTF18-202ENST00000317063 APOL5Q9BWW9 433 aa16.65■□□□□ 0.26
CHTF18-202ENST00000317063 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CHTF18-202ENST00000317063 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CHTF18-202ENST00000317063 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CHTF18-202ENST00000317063 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CHTF18-202ENST00000317063 ACSL4O60488 711 aa16.65■□□□□ 0.26
CHTF18-202ENST00000317063 PMS2P54278 862 aa16.65■□□□□ 0.26
CHTF18-202ENST00000317063 COG7P83436 770 aa16.65■□□□□ 0.26
CHTF18-202ENST00000317063 RING1Q06587 406 aa16.65■□□□□ 0.26
CHTF18-202ENST00000317063 MSS51Q4VC12 460 aa16.65■□□□□ 0.26
CHTF18-202ENST00000317063 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
CHTF18-202ENST00000317063 GDF15Q99988 308 aa16.65■□□□□ 0.26
CHTF18-202ENST00000317063 SLC46A2Q9BY10 475 aa16.65■□□□□ 0.26
CHTF18-202ENST00000317063 TXLNGYQ9BZA5 131 aa16.65■□□□□ 0.26
CHTF18-202ENST00000317063 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa16.65■□□□□ 0.26
CHTF18-202ENST00000317063 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 APRTP07741 180 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 UBE3AQ05086 875 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 OLIG2Q13516 323 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 KYNUQ16719 465 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 FNBP1LQ5T0N5 605 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PID1Q7Z2X4 250 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 NLRP14Q86W24 1093 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF567Q8N184 647 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ELMOD1Q8N336 334 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ARL8AQ96BM9 186 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ZYG11BQ9C0D3 744 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 EPB41L4BQ9H329 900 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 IGFLR1Q9H665 355 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ASAH2Q9NR71 780 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 CDH22Q9UJ99 828 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PLAAQ9Y263 795 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 TTLL3Q9Y4R7 772 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ACSL3O95573 720 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 GRIA1P42261 906 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 NRIP1P48552 1158 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 GALNT2Q10471 571 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ZBTB17Q13105 803 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC80Q76M96 950 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF354CQ86Y25 554 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ANKMY2Q8IV38 441 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP16.64■□□□□ 0.259e-7■■■□□ 17.7
CHTF18-202ENST00000317063 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 CCL26Q9Y258 94 aa16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 JCHAINP01591 159 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 SHBGP04278 402 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ALDH3A1P30838 453 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 HOXC13P31276 330 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 CFAP58Q5T655 872 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 MREGQ8N565 214 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 SH2D3CQ8N5H7 860 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 NAT8LQ8N9F0 302 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 OR52K2Q8NGK3 314 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 CCHCR1Q8TD31 782 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ASB3Q9Y575 518 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM221A6NGB7 291 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 GOLGA8KD6RF30 607 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 SLC29A2Q14542 456 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 KLHDC10Q6PID8 442 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 POTEHQ6S545 545 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PPIL6Q8IXY8 311 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 IQCKQ8N0W5 287 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 ING5Q8WYH8 240 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 RTP4Q96DX8 246 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 SLC28A3Q9HAS3 691 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 SAYSD1Q9NPB0 183 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 RHBDL2Q9NX52 303 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 UBP1Q9NZI7 540 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PAK5Q9P286 719 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 MAFFQ9ULX9 164 aa16.63■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 CFAP69A5D8W1 941 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 GCATO75600 419 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PTPN3P26045 913 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 OR1E1P30953 314 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 SERPINB6P35237 376 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 SLC11A2P49281 568 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PPARDQ03181 441 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 SPARCL1Q14515 664 aa16.62■□□□□ 0.25
CHTF18-202ENST00000317063 TEAD2Q15562 447 aa16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms