RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 PLD4Q96BZ4 506 aa27.31■■□□□ 1.96
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HOXD8-201ENST00000313173 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
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HOXD8-201ENST00000313173 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
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HOXD8-201ENST00000313173 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP27.29■■□□□ 1.96
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HOXD8-201ENST00000313173 SLC17A7Q9P2U7 560 aa27.29■■□□□ 1.96
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HOXD8-201ENST00000313173 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD8-201ENST00000313173 ADRA1AP35348 466 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD8-201ENST00000313173 PPP3CCP48454 512 aa27.28■■□□□ 1.96
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HOXD8-201ENST00000313173 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
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HOXD8-201ENST00000313173 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 NT5MQ9NPB1 228 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 ALPK3Q96L96 1907 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 STC2O76061 302 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 DHRS4L1P0CG22 281 aa27.26■■□□□ 1.95
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HOXD8-201ENST00000313173 EPHB3P54753 998 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXD8-201ENST00000313173 SLC10A7Q0GE19 358 aa27.26■■□□□ 1.95
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