RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292579.11

ZNF250-201, Transcript of zinc finger protein 250, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF250, Length 6,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF250-201ENST00000292579 SYN3O14994 580 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 OR10H2O60403 315 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 BMP10O95393 424 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 ZNF682O95780 498 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 CSF2RAP15509 400 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 SKP1P63208 163 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 FOXM1Q08050 763 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 TRIM32Q13049 653 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 CCDC126Q96EE4 140 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 FOXP3Q9BZS1 431 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 MID1IP1Q9NPA3 183 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 HACD1B0YJ81 288 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 BAIAP3O94812 1187 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 SLC10A3P09131 477 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 DGKAP23743 735 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 ST3GAL1Q11201 340 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 ALKBH4Q9NXW9 302 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 INPPL1O15357 1258 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 DAB1O75553 588 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 FAM107AO95990 144 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 PAX3P23760 479 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 UBE3AQ05086 875 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 MDM1Q8TC05 714 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 PCED1BQ96HM7 432 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 LGMNQ99538 433 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 NDNQ99608 321 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 NFAT5O94916 1531 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 ATP5HO75947 161 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 SLIT2O94813 1529 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 ICAM3P32942 547 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 GAD2Q05329 585 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 GRB14Q14449 540 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 AMZ1Q400G9 498 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 GPSM1Q86YR5 675 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 CEP70Q8NHQ1 597 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 REPS1Q96D71 796 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 MYO19Q96H55 970 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 PEAK1Q9H792 1746 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 DNM1LO00429 736 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 B4GALT4O60513 344 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 KRT6AP02538 564 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 KRT6BP04259 564 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 KCNA5P22460 613 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 KRT6CP48668 564 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 C16orf46Q6P387 395 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 VSTM1Q6UX27 236 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 FAM228AQ86W67 206 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 TNIP2Q8NFZ5 429 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 RIN3Q8TB24 985 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 VCPIP1Q96JH7 1222 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 SNX27Q96L92 541 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 THTPAQ9BU02 230 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 SLC4A5Q9BY07 1137 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 ENTPD4Q9Y227 616 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 LRRC72A6NJI9 287 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 CST3P01034 146 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 UMPSP11172 480 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 NUDT2P50583 147 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 ATAD3BQ5T9A4 648 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 KIRREL3Q8IZU9 778 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 DTX3LQ8TDB6 740 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 POF1BQ8WVV4 589 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 THEGQ9P2T0 379 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 RABGEF1Q9UJ41 708 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 CHKBQ9Y259 395 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 KIF13AQ9H1H9 1805 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 MYO1CO00159 1063 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 WNT7AO00755 349 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 FOSL2P15408 326 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 POU1F1P28069 291 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 ARHGAP1Q07960 439 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 NFYCQ13952 458 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF250-201ENST00000292579 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms