RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 CLPXO76031 633 aa22.29■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 TGM1P22735 817 aa22.29■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 ETV3P41162 512 aa22.29■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 ZNF846Q147U1 533 aa22.29■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 CES4AQ5XG92 561 aa22.29■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 TAS2R42Q7RTR8 314 aa22.29■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 KIAA2013Q8IYS2 634 aa22.29■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.29■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 TCF12Q99081 682 aa22.29■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 C12orf10Q9HB07 376 aa22.29■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.29■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA8OA6NCC3 632 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 TRIM64A6NGJ6 449 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA8NF8WBI6 632 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 GJB1P08034 283 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 CHI3L2Q15782 390 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 USP37Q86T82 979 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 DHRS9Q9BPW9 319 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 PLXNB2O15031 1838 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 MYL4P12829 197 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 TNNI1P19237 187 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 HPCAL1P37235 193 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 TRAF2Q12933 501 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 FLOT2Q14254 428 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 TMEM26Q6ZUK4 368 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 FRMD7Q6ZUT3 714 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 ARMCX2Q7L311 632 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 GIPC2Q8TF65 315 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 NOL3O60936 208 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 M6PRP20645 277 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 SSTR1P30872 391 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 FMO1Q01740 532 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 ZACNQ401N2 412 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 FAM167AQ96KS9 214 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 YME1L1Q96TA2 773 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 COPEO14579 308 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 MSCO60682 206 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 VNN1O95497 513 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 RALAP11233 206 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 CYP11B1P15538 503 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 P2RX3P56373 397 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 IKBKEQ14164 716 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 NATD1Q8N6N6 113 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 RTKNQ9BST9 563 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 MECRQ9BV79 373 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.27■■□□□ 1.16
PITX1-201ENST00000265340 HTTP42858 3142 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 AREL1O15033 823 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 CCNA2P20248 432 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 GNG2P59768 71 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 ENPEPQ07075 957 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 PPP2R5DQ14738 602 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 RAB39AQ14964 217 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 ATAD3BQ5T9A4 648 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 TNIP2Q8NFZ5 429 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 GIMAP1Q8WWP7 306 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 NANOGQ9H9S0 305 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 PCDH12Q9NPG4 1184 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 FAM155BO75949 473 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 BCL10O95999 233 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 HLA-DRAP01903 254 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 MAPK4P31152 587 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 TNFSF9P41273 254 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 PMS2P3Q13401 168 aa22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms