RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 OTOAQ7RTW8 1153 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ADCK1Q86TW2 530 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SERAC1Q96JX3 654 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 BTBD19C9JJ37 291 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 E9PBE3 544 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 M0R2N6 131 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 KLHL41O60662 606 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PCNAP12004 261 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MMP8P22894 467 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TTPAP49638 278 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 AADACL2Q6P093 401 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PLD3Q8IV08 490 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SEMA4DQ92854 862 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CCT7Q99832 543 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MAGEC1O60732 1142 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 BMP10O95393 424 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ADRA1DP25100 572 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 HALP42357 657 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FUT11Q495W5 492 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 VSTM1Q6UX27 236 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 BSNDQ8WZ55 320 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 BHMTQ93088 406 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TADA1Q96BN2 335 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SNX27Q96L92 541 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NLNQ9BYT8 704 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CEP41Q9BYV8 373 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CIPCQ9C0C6 399 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 F8W810 466 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ALOX15BO15296 676 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FGFR1P11362 822 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CD52P31358 61 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NOMO1Q15155 1222 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MON1AQ86VX9 555 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DACH2Q96NX9 599 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DPY30Q9C005 99 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ACTR8Q9H981 624 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DMAC2Q9NW81 257 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CROTQ9UKG9 612 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC154A6NI56 674 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FCHO1O14526 889 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DYRK3O43781 588 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PIGRP01833 764 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FECHP22830 423 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PRMT2P55345 433 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TAS2R40P59535 323 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 IL2P60568 153 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 STAG3L4Q8TBR4 150 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MID1IP1Q9NPA3 183 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFAF1Q9Y375 327 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RIPK3Q9Y572 518 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 APOA1P02647 267 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 S100A5P33763 92 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 HPCAL1P37235 193 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PRKCQQ04759 706 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC36Q1X8D7 754 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 AGKQ53H12 422 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SPRYD7Q5W111 196 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NEPROQ6NW34 567 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 GPSM1Q86YR5 675 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 P3H2Q8IVL5 708 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SLC4A11Q8NBS3 891 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 OR52K1Q8NGK4 314 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DLG3Q92796 817 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms