RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 NCANO14594 1321 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 E2F8A0AVK6 867 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CAPN8A6NHC0 703 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 STX11O75558 287 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 EPN2O95208 641 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 DHFRP00374 187 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PCNAP12004 261 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PRKCIP41743 596 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ELK3P41970 407 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 BCAT1P54687 386 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PLA2G4FQ68DD2 849 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PAGE2Q7Z2X7 111 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ITIH5Q86UX2 942 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TRABD2AQ86V40 505 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ALLCQ8N6M5 410 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TMCO6Q96DC7 493 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 DNAJC18Q9H819 358 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SNX7Q9UNH6 387 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SPACA6W5XKT8 324 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PRRG1O14668 218 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 LRG1P02750 347 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 DBTP11182 482 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 GRK3P35626 688 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 IRF5Q13568 498 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 DGCR6Q14129 220 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 C6orf183Q5T699 404 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 FKBP1CQ5VVH2 108 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 IL31Q6EBC2 164 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 FAR1Q8WVX9 515 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TMCC2O75069 709 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TSPAN19P0C672 248 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CCNB1P14635 433 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CYP11B1P15538 503 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MYL12AP19105 171 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 STARP49675 285 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 BMPR2Q13873 1038 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PYDC2Q56P42 97 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PAGE2BQ5JRK9 111 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 FAM182BQ5T319 152 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SLC9A4Q6AI14 798 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PLET1Q6UQ28 207 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 FAM228AQ86W67 206 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CPVLQ9H3G5 476 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MUC13Q9H3R2 512 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CXCL11O14625 94 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MSH4O15457 936 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SSNA1O43805 119 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SGPL1O95470 568 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF682O95780 498 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PGK2P07205 417 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PGAM1P18669 254 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ITGAXP20702 1163 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CRABP2P29373 138 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 LRRC74AQ0VAA2 488 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 YME1L1Q96TA2 773 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MRIQ9BWK5 157 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ELOVL6Q9H5J4 265 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 GGA3Q9NZ52 723 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MLXQ9UH92 298 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 STON1Q9Y6Q2 735 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 FRMPD4Q14CM0 1322 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms