RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 MTFR1LQ9H019 292 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ACAD9Q9H845 621 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 C1orf112Q9NSG2 853 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 RNF146Q9NTX7 359 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTPRM-215ENST00000583289 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.652e-6■■■□□ 14.6
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PTPRM-215ENST00000583289 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 MLST8Q9BVC4 326 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 PACSIN1Q9BY11 444 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 IMPG2Q9BZV3 1241 aa4.77□□□□□ -1.65
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