RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570185.1

RBBP6-212, Transcript of RB binding protein 6, ubiquitin ligase, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP6, Length 505 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6-212ENST00000570185 ZNF248Q8NDW4 579 aa7.16□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 KCNE4Q8WWG9 221 aa7.16□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 OR8D1Q8WZ84 308 aa7.16□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa7.16□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 FAXDC2Q96IV6 333 aa7.16□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 HSFY1Q96LI6 401 aa7.16□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 SPATA32Q96LK8 384 aa7.16□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.16□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 NT5C1BQ96P26 610 aa7.16□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 SPAG5Q96R06 1193 aa7.16□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 USP25Q9UHP3 1055 aa7.16□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 KLF15Q9UIH9 416 aa7.16□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 CFAP45Q9UL16 551 aa7.16□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 PPM1HQ9ULR3 514 aa7.16□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 SATB2Q9UPW6 733 aa7.16□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 SHROOM3Q8TF72 1996 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 CPED1A4D0V7 1026 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 POM121BA6NF01 834 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 F5H5T6 163 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 K7ESM1 405 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 ATP9BO43861 1147 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 SLC28A2O43868 658 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 STX10O60499 249 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 FBXO21O94952 628 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 ZNF202O95125 648 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 IGLV3-25P01717 112 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 MYL1P05976 194 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 CKMT1AP12532 417 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 ZNF18P17022 549 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 FMO5P49326 533 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 TMPRSS3P57727 454 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 NUCB2P80303 420 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 E2F1Q01094 437 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 APBA1Q02410 837 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 TCEA2Q15560 299 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 ISM2Q6H9L7 571 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 GUSBP11Q6P575 273 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 LINGO4Q6UY18 593 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 IQCHQ86VS3 1027 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 DEFB106AQ8N104 65 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 LMO3Q8TAP4 145 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 IFI44Q8TCB0 444 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 MAPK15Q8TD08 544 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 PSMB7Q99436 277 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 FAM204AQ9H8W3 233 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 ANLNQ9NQW6 1124 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 VPS28Q9UK41 221 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 VANGL2Q9ULK5 521 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 DMTF1Q9Y222 760 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 OR51B4Q9Y5P0 310 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 ACTL7AQ9Y615 435 aa7.15□□□□□ -1.26
RBBP6-212ENST00000570185 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 TCAF2A6NFQ2 919 aa7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 KCNU1A8MYU2 1149 aa7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 B8ZZF3 427 aa7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 I6L893 689 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 MCF2LO15068 1137 aa7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 ARHGAP6O43182 974 aa7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 SLC7A4O43246 635 aa7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 SPINT1O43278 529 aa7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 PCDH8O95206 1070 aa7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 SRCP12931 536 aa7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 KRT5P13647 590 aa7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 C6P13671 934 aa7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 CD44P16070 742 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 AKT2P31751 481 aa7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 NNMTP40261 264 aa7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 LSSP48449 732 aa7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 RPL34P49207 117 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 RHDQ02161 417 aa7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 VAC14Q08AM6 782 aa7.14□□□□□ -1.27
RBBP6-212ENST00000570185 NNTQ13423 1086 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms