RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555904.1

ABCD4-223, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 3

Gene ABCD4, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-223	ENST00000555904	ADCY2	Q08462	1091 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	AP1B1	Q10567	949 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	XRCC4	Q13426	336 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	NOMO1	Q15155	1222 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	NPNT	Q6UXI9	565 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	APCDD1	Q8J025	514 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	BBS5	Q8N3I7	341 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	HDAC11	Q96DB2	347 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	OLFM3	Q96PB7	478 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	NELL2	Q99435	816 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	KLC2	Q9H0B6	622 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	CD320	Q9NPF0	282 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	VPS51	Q9UID3	782 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	NPC1	O15118	1278 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	DCX	O43602	365 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	ALAD	P13716	330 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	NUMB	P49757	651 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	ZXDA	P98168	799 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	IL10RB	Q08334	325 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC20A2	Q08357	652 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	LRRC32	Q14392	662 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	FBXO43	Q4G163	708 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	NETO2	Q8NC67	525 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	ALG14	Q96F25	216 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	LMLN	Q96KR4	655 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF599	Q96NL3	588 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	COL4A2	P08572	1712 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ABCD4-223	ENST00000555904	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	PRRT4	C9JH25	899 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	SNAP91	O60641	907 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	MAFK	O60675	156 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	PRAMEF11	O60813	436 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	RBP3	P10745	1247 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	CD72	P21854	359 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	CCNC	P24863	283 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	RENBP	P51606	427 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	CLCN6	P51797	869 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	SEC13	P55735	322 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	STARD6	P59095	220 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	CCNG2	Q16589	344 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	SDE2	Q6IQ49	451 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	LINGO4	Q6UY18	593 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	CREG2	Q8IUH2	290 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	TTC17	Q96AE7	1141 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	CCDC114	Q96M63	670 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	TSGA13	Q96PP4	275 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	LGMN	Q99538	433 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	CDC23	Q9UJX2	597 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ABCD4-223	ENST00000555904	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37

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