RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 PMEPA1Q969W9 287 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TCF12Q99081 682 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CALN1Q9BXU9 219 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KATNA1O75449 491 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TDP2O95551 362 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CYP3A4P08684 503 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC32Q14392 662 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RPS6KA2Q15349 733 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RESP18Q5W5W9 173 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 LAYNQ6UX15 382 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CPA6Q8N4T0 437 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PAGE5Q96GU1 130 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RILPQ96NA2 401 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MUC3BQ9H195 1237 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CEP72Q9P209 647 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NUP50Q9UKX7 468 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ABCG2Q9UNQ0 655 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 H3BM21 787 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FPGTO14772 594 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 INPPL1O15357 1258 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RRP8O43159 456 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB14O43829 449 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ICMTO60725 284 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 GLUD1P00367 558 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MBP02144 154 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 LINGO3P0C6S8 592 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CSH1P0DML2 217 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CSH2P0DML3 217 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PRKAR1AP10644 381 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJB2P25686 324 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 POU1F1P28069 291 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MTHFRP42898 656 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 VSNL1P62760 191 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PCDH1Q08174 1060 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CUL2Q13617 745 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 E2F2Q14209 437 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SPDYCQ5MJ68 293 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 POTEGQ6S5H5 508 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM270Q6UE05 265 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RADILQ96JH8 1075 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CLIC4Q9Y696 253 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KCPQ6ZWJ8 1503 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC78A2IDD5 438 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NFKBIEO00221 500 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KRIT1O00522 736 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MAP2K7O14733 419 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 LGR5O75473 907 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 APOC1P02654 83 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MYL4P12829 197 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CDK7P50613 346 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NR1H2P55055 460 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CD83Q01151 205 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NCOA4Q13772 614 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MOGQ16653 247 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PHC2Q8IXK0 858 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SLC35F6Q8N357 371 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 LILRB4Q8NHJ6 448 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 HPDLQ96IR7 371 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PBKQ96KB5 322 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 GNPTGQ9UJJ9 305 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC154A6NI56 674 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CAPN14A8MX76 684 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 EML1O00423 815 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms