RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 JOSD2Q8TAC2 188 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 RXFP2Q8WXD0 754 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 BTN2A3PQ96KV6 586 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 CFAP57Q96MR6 1250 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 ACOX2Q99424 681 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 SYT11Q9BT88 431 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 SIK2Q9H0K1 926 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 RAB6CQ9H0N0 254 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 WDCPQ9H6R7 721 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 TMEM74BQ9NUR3 256 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 HCN2Q9UL51 889 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 STAP1Q9ULZ2 295 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 CAPN11Q9UMQ6 739 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 ASXL3Q9C0F0 2248 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PQJ5 194 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 SGK1O00141 431 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 GFRA2O00451 464 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 SPINT1O43278 529 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 CBFA2T2O43439 604 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 ADCY5O95622 1261 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 GYPCP04921 128 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 CALB1P05937 261 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 TPM3P06753 285 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 SLC2A3P11169 496 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 KRT3P12035 628 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 PDGFRAP16234 1089 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 TACR2P21452 398 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 CASP14P31944 242 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 PTGER3P43115 390 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 ZBED6P86452 979 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 CDO1Q16878 200 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 SLC25A52Q3SY17 297 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 MS4A13Q5J8X5 152 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 MON1BQ7L1V2 547 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 LPCAT2Q7L5N7 544 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 CHSY1Q86X52 802 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 SYT12Q8IV01 421 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 TMEFF1Q8IYR6 380 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 MCOLN2Q8IZK6 566 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 CARNMT1Q8N4J0 409 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 PNPLA1Q8N8W4 532 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 CCDC26Q8TAB7 109 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 OLIG1Q8TAK6 271 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 WFDC5Q8TCV5 224 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 RLN3Q8WXF3 142 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 NT5C3BQ969T7 300 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 CRELD1Q96HD1 420 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 SELENOOQ9BVL4 669 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 TKTL2Q9H0I9 626 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 RBSNQ9H1K0 784 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 ANLNQ9NQW6 1124 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 PIGVQ9NUD9 493 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 RRN3Q9NYV6 651 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 MAP10Q9P2G4 905 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.826e-6■□□□□ 9.1
CS-217ENST00000550044 SNX10Q9Y5X0 201 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 CFAP46Q8IYW2 2715 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 SIGLEC16A6NMB1 481 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 WASH3PC4AMC7 463 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.821e-14■■□□□ 12.5
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CS-217ENST00000550044 OPHN1O60890 802 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 PAGE1O75459 146 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 F9P00740 461 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 FTLP02792 175 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 RRM1P23921 792 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 HLA-FP30511 346 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 PRKCIP41743 596 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 SERPINB4P48594 390 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 CXCR3P49682 368 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 NUMBP49757 651 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 AUHQ13825 339 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 CCDC14Q49A88 953 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 TMEM215Q68D42 235 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 WDR59Q6PJI9 974 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-217ENST00000550044 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
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