RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516411.1

RNU6-977P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 977, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-977P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-977P-201ENST00000516411 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 GRM8O00222 908 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 VWA5AO00534 786 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 ACKR2O00590 384 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 ACOT8O14734 319 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 RNMTO43148 476 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 SEPT4O43236 478 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 RGS14O43566 566 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 METTL18O95568 372 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 NFATC1O95644 943 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 DDAH2O95865 285 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 GLUD1P00367 558 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 LCATP04180 440 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 NGFRP08138 427 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 MMP3P08254 477 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 CYP21A2P08686 494 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 T-ENOLP0DO92 83 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 CHRNB1P11230 501 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 CHN1P15882 459 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 CHRNB2P17787 502 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 SERPINA4P29622 427 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 CIITAP33076 1130 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 GJC1P36383 396 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 MLH1P40692 756 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 PNPLA4P41247 253 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 GLUD2P49448 558 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 CENPAP49450 140 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 RPS6KA3P51812 740 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 MVDP53602 400 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 ADORA2A-AS1P86434 159 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 ECT2LQ008S8 904 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 LTBQ06643 244 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 CDK18Q07002 472 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 PMPCAQ10713 525 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 ST3GAL1Q11201 340 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 GPS2Q13227 327 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 BLMHQ13867 455 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 GALNT3Q14435 633 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 SHBQ15464 509 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 RPE65Q16518 533 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 C5orf22Q49AR2 442 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 ALG10Q5BKT4 473 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 ALG10BQ5I7T1 473 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 ENTPD8Q5MY95 495 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 WASHC2DQ5SRD0 308 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 FAM171A1Q5VUB5 890 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 DCAF12L2Q5VW00 463 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 TBC1D9BQ66K14 1250 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 NUGGCQ68CJ6 796 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 ANKRD40Q6AI12 368 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 LIN54Q6MZP7 749 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 MTFR2Q6P444 385 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 KLHL17Q6TDP4 642 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 DLK2Q6UY11 383 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 GPSM1Q86YR5 675 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 CAMK1DQ8IU85 385 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 SCN4BQ8IWT1 228 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 CCDC146Q8IYE0 955 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 RBFAQ8N0V3 343 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 SPICE1Q8N0Z3 855 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 CLIP4Q8N3C7 705 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 PRR26Q8N8Z3 221 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 C7orf57Q8NEG2 295 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 ENGASEQ8NFI3 743 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 SCAMP5Q8TAC9 235 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 SPPL3Q8TCT6 385 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 ELP5Q8TE02 316 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 CLEC4CQ8WTT0 213 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 TMEM170AQ8WVE7 144 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 HMGB4Q8WW32 186 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 MIB2Q96AX9 1013 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 ARRDC3Q96B67 414 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 SH3KBP1Q96B97 665 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF479Q96JC4 524 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 CRB3Q9BUF7 120 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-977P-201ENST00000516411 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms