RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 MIOSQ9NXC5 875 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SPG21Q9NZD8 308 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DTLQ9NZJ0 730 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SENP1Q9P0U3 644 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PADI3Q9ULW8 664 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MYBPHLA2RUH7 354 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NRP1O14786 923 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CHADO15335 359 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.261e-6■■■□□ 14.7
HERC4-211ENST00000492996 DIAPH2O60879 1101 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NPR3P17342 541 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DNAJB1P25685 340 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PTPN9P43378 593 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SCNN1GP51170 649 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CLCNKBP51801 687 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TKTL1P51854 596 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SHC2P98077 582 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 RAB33AQ14088 237 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DPYSL2Q16555 572 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SLC45A4Q5BKX6 768 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TPGS2Q68CL5 300 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DBF4BQ8NFT6 615 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 VN1R3Q9BXE9 311 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NOD2Q9HC29 1040 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NPHS2Q9NP85 383 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 GDAP2Q9NXN4 497 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 STK38LQ9Y2H1 464 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 L3MBTL1Q9Y468 752 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 M0QZ92 97 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 KCNK1O00180 336 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ARNTLO00327 626 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MFSD11O43934 449 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PNPLA4P41247 253 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MATKP42679 507 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MPP3Q13368 585 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 OLIG2Q13516 323 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PDK4Q16654 411 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 EFHC1Q5JVL4 640 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SLC8B1Q6J4K2 584 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DSTYKQ6XUX3 929 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PAQR9Q6ZVX9 377 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 VSIG1Q86XK7 387 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 EDEM1Q92611 657 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ELSPBP1Q96BH3 223 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 KLHL29Q96CT2 875 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ERP27Q96DN0 273 aa7.19□□□□□ -1.26
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HERC4-211ENST00000492996 ULBP1Q9BZM6 244 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TMEM30AQ9NV96 361 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SLC17A6Q9P2U8 582 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 LCHNA4D1U4 455 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CFAP69A5D8W1 941 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 YJEFN3A6XGL0 299 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 E7ENQ6 273 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 E9PAM4 449 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 POMCP01189 267 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 USP17L7P0C7H9 530 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 GHRP10912 638 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 VAV1P15498 845 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ACADSBP45954 432 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CACNA2D1P54289 1103 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NCALDP61601 193 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 IRX4P78413 519 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DEUP1Q05D60 604 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TCEAL5Q5H9L2 206 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MROH9Q5TGP6 573 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CLEC20AQ6ZU45 233 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 OTOAQ7RTW8 1153 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 LRRC6Q86X45 466 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SLC44A1Q8WWI5 657 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PTPRN2Q92932 1015 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 IGSF21Q96ID5 467 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 HSFY1Q96LI6 401 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 AGAP3Q96P47 875 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 POPDC2Q9HBU9 364 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SMYD2Q9NRG4 433 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PIGVQ9NUD9 493 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
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