RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477112.1

DDX17-208, Transcript of DEAD-box helicase 17, human

TSL 2

Gene DDX17, Length 654 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX17-208	ENST00000477112	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	OR10A2	Q9H208	303 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	OR10A4	Q9H209	315 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	EPC1	Q9H2F5	836 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	ARMT1	Q9H993	441 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	PARVG	Q9HBI0	331 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	RLIM	Q9NVW2	624 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	FETUB	Q9UGM5	382 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	CPA4	Q9UI42	421 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	C5	P01031	1676 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	KRT87P	A6NCN2	255 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	ADAMTS3	O15072	1205 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	NPC1	O15118	1278 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	CYP27B1	O15528	508 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	ASAP2	O43150	1006 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	PRPSAP2	O60256	369 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	SEC22B	O75396	215 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	SGPL1	O95470	568 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	IL18BP	O95998	194 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	ASGR1	P07306	291 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	POLR2M	P0CAP2	368 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	SCG2	P13521	617 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	ZNF3	P17036	446 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	ALOX12	P18054	663 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	ATP5J	P18859	108 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	KEL	P23276	732 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	JAK1	P23458	1154 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	TNFSF4	P23510	183 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	GDI1	P31150	447 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	PRKAR2B	P31323	418 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	MCM5	P33992	734 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	RFC4	P35249	363 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	PTGS2	P35354	604 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	SLC16A2	P36021	539 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	HAAO	P46952	286 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	CPA2	P48052	419 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	PIK3CG	P48736	1102 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	VPS41	P49754	854 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	HNMT	P50135	292 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	MAPK10	P53779	464 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	SLC12A3	P55017	1021 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	POLE2	P56282	527 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	ARL4C	P56559	192 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	ARPC4	P59998	168 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	B2M	P61769	119 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	TFAP4	Q01664	338 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	DSC2	Q02487	901 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	PPP3CA	Q08209	521 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	TFCP2	Q12800	502 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	MPP3	Q13368	585 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	MTX1	Q13505	466 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	CUL2	Q13617	745 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	BLMH	Q13867	455 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	DAG1	Q14118	895 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	PLS1	Q14651	629 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	STARD3	Q14849	445 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	TAF5	Q15542	800 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	TAF12	Q16514	161 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	ALG11	Q2TAA5	492 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDX17-208	ENST00000477112	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		3.05	□□□□□ -1.92

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