RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 LHX1P48742 406 aa20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 TUBP50607 506 aa20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 NAGLUP54802 743 aa20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 TSNARE1Q96NA8 513 aa20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 NUF2Q9BZD4 464 aa20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF180Q9UJW8 692 aa20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 PAGE1O75459 146 aa20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 MPSTP25325 297 aa20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 EFEMP1Q12805 493 aa20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF280BQ86YH2 543 aa20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 CNTD1Q8N815 330 aa20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 OR6P1Q8NGX9 317 aa20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 CASP10Q92851 521 aa20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 HCSTQ9UBK5 93 aa20.04■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 AURKAO14965 403 aa20.03■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 PRKCGP05129 697 aa20.03■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 PCSK1P29120 753 aa20.03■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 SPRP35270 261 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 FBXO48Q5FWF7 155 aa20.03■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 MORN1Q5T089 497 aa20.03■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM198Q66K66 360 aa20.03■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 C14orf80Q86SX3 495 aa20.03■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 VPS39Q96JC1 886 aa20.03■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.03■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 SIRPGQ9P1W8 387 aa20.03■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 TBX10O75333 385 aa20.03■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 GJB3O75712 270 aa20.03■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 TEX44Q53QW1 395 aa20.03■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 URGCPQ8TCY9 931 aa20.03■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 EBF2Q9HAK2 575 aa20.03■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 SIP14410 1827 aa20.03■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 SHROOM3Q8TF72 1996 aa20.03■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 HACD1B0YJ81 288 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM233B4DJY2 109 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 SERPINB6P35237 376 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 SOX11P35716 441 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 ADAM17P78536 824 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 MBLAC2Q68D91 279 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 BHMTQ93088 406 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 ELMO2Q96JJ3 720 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 NT5MQ9NPB1 228 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 KCNK4Q9NYG8 393 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 COPG2Q9UBF2 871 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 TSHRP16473 764 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 MAGEA3P43357 314 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 PRPSAP1Q14558 356 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 PTPRCAPQ14761 206 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 KCNA10Q16322 511 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 SPDYAQ5MJ70 313 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 SCUBE1Q8IWY4 988 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 SAR1AQ9NR31 198 aa20.02■□□□□ 0.8
TTLL3-210ENST00000427220 A0A1W2PQH9 124 aa20.02■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 ODC1P11926 461 aa20.02■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 MX2P20592 715 aa20.02■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 SLC5A3P53794 718 aa20.02■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 TRIB2Q92519 343 aa20.02■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.02■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 AP2A1O95782 977 aa20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 DNAJC9Q8WXX5 260 aa20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 NMUR1Q9HB89 426 aa20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 CNGB3Q9NQW8 809 aa20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.792e-11■■■□□ 16.1
TTLL3-210ENST00000427220 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 TSPY1Q01534 308 aa20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 C6orf163Q5TEZ5 329 aa20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 UCMAQ8WVF2 138 aa20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 TAGLN3Q9UI15 199 aa20.01■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 OR51F1A6NGY5 319 aa20■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 GABRDO14764 452 aa20■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 GLUD2P49448 558 aa20■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 PPM1LQ5SGD2 360 aa20■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF470Q6ECI4 717 aa20■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 MAPK15Q8TD08 544 aa20■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 SPDL1Q96EA4 605 aa20■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 PHF21BQ96EK2 531 aa20■□□□□ 0.79
TTLL3-210ENST00000427220 YIPF3Q9GZM5 350 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms