RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409766.7

USP39-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP39, Length 2,033 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-204ENST00000409766 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 SEPT8Q92599 483 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 E2F7Q96AV8 911 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 KCNK13Q9HB14 408 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 FNIP2Q9P278 1114 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 PITPNM1O00562 1244 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TBC1D4O60343 1298 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ARPP19P56211 112 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 PDE1BQ01064 536 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 GPR17Q13304 367 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 CES4AQ5XG92 561 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 FUT10Q6P4F1 479 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 LRRC49Q8IUZ0 686 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 NUDCD3Q8IVD9 361 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 RBBP8Q99708 897 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 CRISPLD1Q9H336 500 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 EMCNQ9ULC0 261 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 MTMR11A4FU01 709 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 FKTNO75072 461 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 GLRA3O75311 464 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ANXA9O76027 345 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 VNN2O95498 520 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 GSRP00390 522 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 CPB1P15086 417 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 BST1Q10588 318 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 EFEMP1Q12805 493 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 SPDYAQ5MJ70 313 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ATG16L1Q676U5 607 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 FBXO32Q969P5 355 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 KLHL29Q96CT2 875 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 C7orf26Q96N11 449 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 AGAP2Q99490 1192 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 KIFC1Q9BW19 673 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 DCDC2Q9UHG0 476 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TBX18O95935 607 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 NQO1P15559 274 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 PRMT2P55345 433 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 KCNJ2P63252 427 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TMPRSS15P98073 1019 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 CHI3L2Q15782 390 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 MS4A13Q5J8X5 152 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 RTP2Q5QGT7 225 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ATP2A3Q93084 1043 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ISL2Q96A47 359 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 A0A0G2JND7 137 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 MGRN1O60291 552 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 MAGEA12P43365 314 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 OCRLQ01968 901 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 STRA8Q7Z7C7 330 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 SPATA17Q96L03 361 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TXLNGQ9NUQ3 528 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 NUMBLQ9Y6R0 609 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 SCN5AQ14524 2016 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ATP5HO75947 161 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 HLA-DQB2P05538 268 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 GALTP07902 379 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 NMBRP28336 390 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TYK2P29597 1187 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 SPRP35270 261 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 PSEN1P49768 467 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 LIMK2P53671 638 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TAF10Q12962 218 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ARHGEF6Q15052 776 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 DBN1Q16643 649 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 INSCQ1MX18 579 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 RASIP1Q5U651 963 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms