RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 AOC1P19801 751 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 MX2P20592 715 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 GRK2P25098 689 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 PCSK6P29122 969 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 RPL5P46777 297 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 RABGGTBP53611 331 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 EPHB1P54762 984 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 CDC42EP1Q00587 391 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 HIC1Q14526 733 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 RALGPS1Q5JS13 557 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 SPANXN3Q5MJ09 141 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 SLC7A14Q8TBB6 771 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 DNAJB3Q8WWF6 145 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 PIGVQ9NUD9 493 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 COPG2Q9UBF2 871 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 CLPTM1O96005 669 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 CPA3P15088 417 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 ATP6V1B1P15313 513 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 IDH3AP50213 366 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 MAP3K7CLP57077 242 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 TUBB3Q13509 450 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 TLR1Q15399 786 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 GRAMD1BQ3KR37 738 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 GRTP1Q5TC63 336 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 HFE2Q6ZVN8 426 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 TMC7Q7Z402 723 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 STRA8Q7Z7C7 330 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF554Q86TJ5 538 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 TNS4Q8IZW8 715 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 DCLK2Q8N568 766 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 ZFP28Q8NHY6 868 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 WNT8BQ93098 351 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 NPY6RQ99463 290 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 CPNE1Q99829 537 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 C1orf21Q9H246 121 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 SNX15Q9NRS6 342 aa13.45□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 BTBD19C9JJ37 291 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 FAM72CH0Y354 149 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 STRNO43815 780 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 SIN3BO75182 1162 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 SUPT3HO75486 399 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 NPR3P17342 541 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 ABCG1P45844 678 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 LILRA4P59901 499 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 INSCQ1MX18 579 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 MYLK3Q32MK0 819 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 FAM72AQ5TYM5 149 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 FAM72DQ6L9T8 149 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 FAM72BQ86X60 149 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 LRRC40Q9H9A6 602 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 BFARQ9NZS9 450 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 IGSF9Q9P2J2 1179 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 CAPN8A6NHC0 703 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 AP1G1O43747 822 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 PRKCGP05129 697 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 ERCC2P18074 760 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 SERPINB6P35237 376 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 SPRP35270 261 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 TKTL1P51854 596 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 BTKQ06187 659 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 PAOXQ6QHF9 649 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 ATG14Q6ZNE5 492 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 ICA1LQ8NDH6 482 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM40Q8WWA1 233 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 SORT1Q99523 831 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 VANGL2Q9ULK5 521 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa13.44□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 LOC100653049A0A140TA62 436 aa13.43□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 KRT34O76011 436 aa13.43□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 RAG1P15918 1043 aa13.43□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 FUT4P22083 530 aa13.43□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 PTPN3P26045 913 aa13.43□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 PMLP29590 882 aa13.43□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 ADRA1BP35368 520 aa13.43□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 COPAP53621 1224 aa13.43□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 DPYSQ14117 519 aa13.43□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 RABGAP1LQ5R372 815 aa13.43□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 WSCD1Q658N2 575 aa13.43□□□□□ -0.26
TMOD1-202ENST00000375175 PDPK2PQ6A1A2 396 aa13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms