RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326828.5

CHRNA3-201, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 3 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHRNA3, Length 3,202 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3-201ENST00000326828 CEP350Q5VT06 3117 aa14.56□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 A0A0A0MRY4 1105 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 MAFGO15525 162 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 ATP6AP2O75787 350 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 STAG3L1P0CL83 205 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 VDRP11473 427 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 TPSB2P20231 275 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 GLDCP23378 1020 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 NME3Q13232 169 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 TPSAB1Q15661 275 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 RTP4Q96DX8 246 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 SPATA13Q96N96 652 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 TRIM8Q9BZR9 551 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 TMEM134Q9H6X4 195 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 CHRAC1Q9NRG0 131 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 MYRFQ9Y2G1 1151 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 NEMP2A6NFY4 417 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 NRP1O14786 923 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 GIPC1O14908 333 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 SEMA5AQ13591 1074 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 TTC30AQ86WT1 665 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 HERC6Q8IVU3 1022 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 THAP11Q96EK4 314 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 V9GYQ6 96 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 LTBP1Q14766 1721 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 IQCF3P0C7M6 154 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 ARL4AP40617 200 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 POU5F1BQ06416 359 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 APOFQ13790 326 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 ZFP1Q6P2D0 407 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 LPGAT1Q92604 370 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 BLOC1S6Q9UL45 172 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 MATN2O00339 956 aa14.54□□□□□ -0.08
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CHRNA3-201ENST00000326828 ABCD1P33897 745 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 EFNA5P52803 228 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 RABGGTBP53611 331 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 IKBKEQ14164 716 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 CCDC153Q494R4 210 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 OGFOD2Q6N063 350 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 FNDC8Q8TC99 324 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 HESX1Q9UBX0 185 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 PFKMP08237 780 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 PSME3P61289 254 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 AGKQ53H12 422 aa14.54□□□□□ -0.08
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CHRNA3-201ENST00000326828 GPR107Q5VW38 600 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 ZNF280DQ6N043 979 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 ILDR2Q71H61 639 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 OFCC1Q8IZS5 231 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 OR9I1Q8NGQ6 314 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 ZNF670Q9BS34 389 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 BCO2Q9BYV7 579 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 GMEB1Q9Y692 573 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 J3QRK9 145 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 MT-ND1P03886 318 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 SLC6A3Q01959 620 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 MPP3Q13368 585 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 PRPSAP1Q14558 356 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 GRM3Q14832 879 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 PPP1R3AQ16821 1122 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA3-201ENST00000326828 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
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