RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 SLC12A1Q13621 1099 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 ENPP2Q13822 863 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 CRY1Q16526 586 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 IL31Q6EBC2 164 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF662Q6ZS27 426 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 DCAF4L2Q8NA75 395 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 FAF2Q96CS3 445 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 TSGA10Q9BZW7 698 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 MMP17Q9ULZ9 603 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 PLA2G4CQ9UP65 541 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 J3KR12 359 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 K7ESF4 209 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 MFSD11O43934 449 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 HOXB2P14652 356 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 HTR7P34969 479 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 CDKN2BP42772 138 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 CXCL12P48061 93 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 GBE1Q04446 702 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 SERINC3Q13530 473 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 PDK2Q15119 407 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 DCAF12L1Q5VU92 463 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 AFMIDQ63HM1 303 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 SYT13Q7L8C5 426 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 PEX26Q7Z412 305 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 CACUL1Q86Y37 369 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 UCMAQ8WVF2 138 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 RNF157Q96PX1 679 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 GABRG3Q99928 467 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF670Q9BS34 389 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 MAGEH1Q9H213 219 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 DFFAO00273 331 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 LAMTOR5O43504 91 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 EPHX1P07099 455 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 PYGMP11217 842 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 SRCP12931 536 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 CTNNA2P26232 953 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 OXCT1P55809 520 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 DYNLT1P63172 113 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 TAZQ16635 292 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 KAZNQ674X7 775 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 TMCO3Q6UWJ1 677 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 NPNTQ6UXI9 565 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF783Q6ZMS7 281 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF354CQ86Y25 554 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 KATNAL2Q8IYT4 538 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 TXLNBQ8N3L3 684 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 PLD5Q8N7P1 536 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 FRS2Q8WU20 508 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 HEMGNQ9BXL5 484 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 CD93Q9NPY3 652 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 AMFRQ9UKV5 643 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 CKAP5Q14008 2032 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 H0Y858 1186 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 RNF103O00237 685 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 ASLP04424 464 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 TDGF1P13385 188 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 MAGEA9P43362 315 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 NDST2P52849 883 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 ANGPT1Q15389 498 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 DLG2Q15700 870 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 ACCSLQ4AC99 568 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 ANO7Q6IWH7 933 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 Q6ZVU0 165 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 MAP7D3Q8IWC1 876 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 SH2D3CQ8N5H7 860 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 ATP11CQ8NB49 1132 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 PRSS33Q8NF86 280 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-201ENST00000309641 PTPRN2Q92932 1015 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms