RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
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TRIM54-201ENST00000296098 PLXNA3P51805 1871 aa24.43■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 PRKCGP05129 697 aa24.42■■□□□ 1.5
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TRIM54-201ENST00000296098 AQP5P55064 265 aa24.42■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 FAM13CQ8NE31 585 aa24.42■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 LINC01599Q8WXQ3 324 aa24.42■■□□□ 1.5
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TRIM54-201ENST00000296098 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
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TRIM54-201ENST00000296098 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
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TRIM54-201ENST00000296098 IL12RB2Q99665 862 aa24.42■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 SLC39A8Q9C0K1 460 aa24.42■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM216Q9P0N5 145 aa24.42■■□□□ 1.5
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TRIM54-201ENST00000296098 TIMM44O43615 452 aa24.41■■□□□ 1.5
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TRIM54-201ENST00000296098 OR1G1P47890 313 aa24.41■■□□□ 1.5
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TRIM54-201ENST00000296098 COLGALT2Q8IYK4 626 aa24.41■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 SPATA22Q8NHS9 363 aa24.41■■□□□ 1.5
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TRIM54-201ENST00000296098 TBL1YQ9BQ87 522 aa24.41■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 SIKE1Q9BRV8 207 aa24.41■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 GLOD4Q9HC38 313 aa24.41■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 COPG2Q9UBF2 871 aa24.41■■□□□ 1.5
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TRIM54-201ENST00000296098 E9PAM4 449 aa24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 MATN3O15232 486 aa24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 ANXA9O76027 345 aa24.4■■□□□ 1.5
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TRIM54-201ENST00000296098 NMBRP28336 390 aa24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
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TRIM54-201ENST00000296098 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 GLT1D1Q96MS3 346 aa24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 BTBD10Q9BSF8 475 aa24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 KIFC1Q9BW19 673 aa24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 TBC1D13Q9NVG8 400 aa24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 SCML2Q9UQR0 700 aa24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 L3MBTL1Q9Y468 752 aa24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 HS3ST4Q9Y661 456 aa24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 KCNU1A8MYU2 1149 aa24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 MPOP05164 745 aa24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 SLC1A6P48664 564 aa24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 TUBP50607 506 aa24.4■■□□□ 1.5
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 OSER1Q9NX31 292 aa24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 ARMCX1Q9P291 453 aa24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 E2F8A0AVK6 867 aa24.39■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 ITM2AO43736 263 aa24.39■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 F7P08709 466 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 GRK2P25098 689 aa24.39■■□□□ 1.5
TRIM54-201ENST00000296098 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.39■■□□□ 1.5
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TRIM54-201ENST00000296098 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
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TRIM54-201ENST00000296098 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa24.39■■□□□ 1.49
TRIM54-201ENST00000296098 A0A096LPK6 155 aa24.38■■□□□ 1.49
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