RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581224.5

TRIM16-222, Transcript of tripartite motif containing 16, human

TSL 3

Gene TRIM16, Length 815 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM16-222	ENST00000581224	ZSCAN26	Q16670	478 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	C5orf22	Q49AR2	442 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	AFMID	Q63HM1	303 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	TRABD2A	Q86V40	505 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	B3GALT6	Q96L58	329 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	PWWP2A	Q96N64	755 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	FCRL5	Q96RD9	977 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	PAFAH2	Q99487	392 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	MAGEH1	Q9H213	219 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	PRO3102	Q9H379	93 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	TRABD	Q9H4I3	376 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	VPS45	Q9NRW7	570 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	EURL	Q9NYK6	297 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	DPP7	Q9UHL4	492 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TRIM16-222	ENST00000581224		A0A1W2PPC1	479 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224		I6L893	689 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	KCNK1	O00180	336 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	TM9SF1	O15321	606 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	ACSL4	O60488	711 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	RAMP2	O60895	175 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	CLDN11	O75508	207 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	ALDH1A2	O94788	518 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	GJB5	O95377	273 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	MAP3K6	O95382	1288 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	JCHAIN	P01591	159 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	MT-ND3	P03897	115 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	ADH1A	P07327	375 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	CTSA	P10619	480 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	CHN1	P15882	459 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	ATF6	P18850	670 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	PSMB4	P28070	264 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	HADHA	P40939	763 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	GUCY1A3	Q02108	690 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	UBE3A	Q05086	875 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	TNK2	Q07912	1038 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	IL10RB	Q08334	325 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	MPP3	Q13368	585 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	SPARCL1	Q14515	664 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	TMED2	Q15363	201 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	MSS51	Q4VC12	460 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	RASIP1	Q5U651	963 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	MARC1	Q5VT66	337 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	STEAP4	Q687X5	459 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	CASC4	Q6P4E1	433 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	POTEH	Q6S545	545 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	CHSY1	Q86X52	802 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	MIB1	Q86YT6	1006 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	GIPC2	Q8TF65	315 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	PSMG2	Q969U7	264 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	GCNA	Q96QF7	691 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	RAD9A	Q99638	391 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	GLOD4	Q9HC38	313 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	OSER1	Q9NX31	292 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	TBK1	Q9UHD2	729 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	TMEM120B	A0PK00	339 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	C2CD2L	O14523	706 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	MAFK	O60675	156 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	VNN2	O95498	520 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TRIM16-222	ENST00000581224	PAM	P19021	973 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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