RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581180.1

MKS1-210, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 2

Gene MKS1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-210ENST00000581180 CALN1Q9BXU9 219 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 LRRC19Q9H756 370 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 DONSONQ9NYP3 566 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 SIT1Q9Y3P8 196 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 NCAM2O15394 837 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 TIMM44O43615 452 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 RNF40O75150 1001 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
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MKS1-210ENST00000581180 ACVRL1P37023 503 aa15.48■□□□□ 0.07
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MKS1-210ENST00000581180 RPS9P46781 194 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
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MKS1-210ENST00000581180 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
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MKS1-210ENST00000581180 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa15.48■□□□□ 0.07
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MKS1-210ENST00000581180 KCNV2Q8TDN2 545 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 USP33Q8TEY7 942 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 SORCS1Q8WY21 1168 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
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MKS1-210ENST00000581180 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 PTPRNQ16849 979 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa15.47■□□□□ 0.07
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MKS1-210ENST00000581180 SLC39A8Q9C0K1 460 aa15.47■□□□□ 0.07
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MKS1-210ENST00000581180 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa15.46■□□□□ 0.07
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MKS1-210ENST00000581180 RASA4O43374 803 aa15.46■□□□□ 0.07
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MKS1-210ENST00000581180 GPR37L1O60883 481 aa15.46■□□□□ 0.07
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MKS1-210ENST00000581180 ETFBP38117 255 aa15.46■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
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MKS1-210ENST00000581180 SULT2A1Q06520 285 aa15.46■□□□□ 0.07
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MKS1-210ENST00000581180 TFDP3Q5H9I0 405 aa15.46■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 DCAF12L1Q5VU92 463 aa15.46■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 TP53INP2Q8IXH6 220 aa15.46■□□□□ 0.07
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MKS1-210ENST00000581180 PLD5Q8N7P1 536 aa15.46■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 IL17RCQ8NAC3 791 aa15.46■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 NETO2Q8NC67 525 aa15.46■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa15.46■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 HMCESQ96FZ2 354 aa15.46■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 MRGPRX3Q96LB0 322 aa15.46■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 ACOX2Q99424 681 aa15.46■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 TLR10Q9BXR5 811 aa15.46■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa15.46■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 ATP13A1Q9HD20 1204 aa15.46■□□□□ 0.07
MKS1-210ENST00000581180 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa15.46■□□□□ 0.07
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