RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575171.1

NXN-208, Transcript of nucleoredoxin, human

TSL 2

Gene NXN, Length 544 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NXN-208	ENST00000575171	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	NOTCH4	Q99466	2003 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	TM4SF5	O14894	197 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	IRAK2	O43187	625 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	NFATC1	O95644	943 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	APOE	P02649	317 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	MYBL1	P10243	752 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	PDGFRA	P16234	1089 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	GPD1	P21695	349 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	SDC4	P31431	198 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	SOX9	P48436	509 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	DEUP1	Q05D60	604 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	PCDH1	Q08174	1060 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	RUNX3	Q13761	415 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	ANGPT1	Q15389	498 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	SLC18A3	Q16572	532 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	CDO1	Q16878	200 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	TRNP1	Q6NT89	227 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	HTR3D	Q70Z44	454 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	PANX2	Q96RD6	677 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	TBCB	Q99426	244 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	NPY6R	Q99463	290 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	THAP2	Q9H0W7	228 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	ISCU	Q9H1K1	167 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	PARVA	Q9NVD7	372 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	RRN3	Q9NYV6	651 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	ARNTL	O00327	626 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	MSTN	O14793	375 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	GREM1	O60565	184 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	IGLV3-25	P01717	112 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	KLKB1	P03952	638 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	CYP17A1	P05093	508 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	DES	P17661	470 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	SLC11A2	P49281	568 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	GALC	P54803	685 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	RING1	Q06587	406 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	MAMLD1	Q13495	774 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	DHCR24	Q15392	516 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	ANO4	Q32M45	955 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	FLCN	Q8NFG4	579 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	ECT2	Q9H8V3	914 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	WNT16	Q9UBV4	365 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	COL4A3	Q01955	1670 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	GIPC1	O14908	333 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	CCP110	O43303	1012 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	ACSL4	O60488	711 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	TSPAN3	O60637	253 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	IGLV3-27	P01718	113 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	CYBB	P04839	570 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NXN-208	ENST00000575171	SLC2A3	P11169	496 aa		10.05	□□□□□ -0.8

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