RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP9B	O43861	1147 aa		22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	CEACAM1	P13688	526 aa		22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNA4	P22459	653 aa		22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	GRIK2	Q13002	908 aa		22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC14	Q49A88	953 aa		22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB6C	Q53S08	254 aa		22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	PIP4P1	Q86T03	277 aa		22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM131B	Q86XD5	332 aa		22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	STK40	Q8N2I9	435 aa		22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		22.38	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		22.37	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	MID1	O15344	667 aa		22.37	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	PML	P29590	882 aa		22.37	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	NNMT	P40261	264 aa		22.37	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		22.37	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	BIRC7	Q96CA5	298 aa		22.37	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMB7	Q99436	277 aa		22.37	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		22.37	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	MPP6	Q9NZW5	540 aa		22.37	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	VPS28	Q9UK41	221 aa		22.37	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200		E9PAM4	449 aa		22.36	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC8A1	P32418	973 aa		22.36	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPN9	P43378	593 aa		22.36	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	22.36	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP11A	P98196	1134 aa		22.36	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	BNC1	Q01954	994 aa		22.36	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC31	Q6UY01	552 aa		22.36	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	22.36	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		22.36	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	22.36	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	AGPAT1	Q99943	283 aa		22.36	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		22.36	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		22.36	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		22.36	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		22.36	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	FZD4	Q9ULV1	537 aa		22.36	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		22.36	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		22.36	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		22.36	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PP55	124 aa		22.35	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		22.35	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	OPHN1	O60890	802 aa		22.35	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	GJB6	O95452	261 aa		22.35	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV4-34	P06331	123 aa		22.35	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	CD59	P13987	128 aa		22.35	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	22.35	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	MON1B	Q7L1V2	547 aa		22.35	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		22.35	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		22.35	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		22.35	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB124	Q8NES8	71 aa		22.35	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	BAP1	Q92560	729 aa		22.35	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		22.35	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	SYT11	Q9BT88	431 aa		22.35	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	MUC3B	Q9H195	1237 aa		22.35	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		22.35	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		22.35	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	RHOC	P08134	193 aa		22.34	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	C5AR1	P21730	350 aa		22.34	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	SDC4	P31431	198 aa		22.34	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	22.34	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF165	P49910	485 aa		22.34	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	GALC	P54803	685 aa		22.34	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	22.34	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	STRADA	Q7RTN6	431 aa		22.34	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		22.34	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	C3orf20	Q8ND61	904 aa		22.34	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	MYO6	Q9UM54	1294 aa		22.34	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0D9SEW6	157 aa		22.33	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	SMTNL1	A8MU46	457 aa		22.33	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	SRGAP2	O75044	1071 aa		22.33	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	FSBP	O95073	299 aa		22.33	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	ADH1B	P00325	375 aa		22.33	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	MT-CO1	P00395	513 aa		22.33	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT3	P12035	628 aa		22.33	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	FER	P16591	822 aa		22.33	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	GOT1	P17174	413 aa		22.33	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	CD27	P26842	260 aa		22.33	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	ADRA1B	P35368	520 aa		22.33	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMD8	P48556	350 aa		22.33	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	22.33	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC14A1	Q13336	389 aa		22.33	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	IQCB1	Q15051	598 aa		22.33	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	DLG2	Q15700	870 aa		22.33	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	CDO1	Q16878	200 aa		22.33	■■□□□ 1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		22.33	■■□□□ 1.17

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.7 ms