RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ATG16L1	Q676U5	607 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	LAYN	Q6UX15	382 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	UNC13D	Q70J99	1090 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CNGA4	Q8IV77	575 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	AFG1L	Q8WV93	481 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX21	Q969T3	373 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	COQ8B	Q96D53	544 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF125	Q96EQ8	232 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	YME1L1	Q96TA2	773 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TRMO	Q9BU70	441 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCG4	Q9H172	646 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MUC13	Q9H3R2	512 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CPA4	Q9UI42	421 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ICK	Q9UPZ9	632 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2W5	A6NFC9	320 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957		H0Y3Z8	333 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SMIM22	K7EJ46	135 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MYO1C	O00159	1063 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE2C	O00762	179 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SPTLC2	O15270	562 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TJP3	O95049	919 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	UNC5C	O95185	931 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	F9	P00740	461 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	FES	P07332	822 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CSF1R	P07333	972 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCD3	P28288	659 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TM4SF1	P30408	202 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC5A2	P31639	672 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	GRK5	P34947	590 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP6V1E1	P36543	226 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	RGS2	P41220	211 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	VIPR2	P41587	438 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SOX8	P57073	446 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	RBP5	P82980	135 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MC1R	Q01726	317 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	STK4	Q13043	487 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	IQCB1	Q15051	598 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPN14	Q15678	1187 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ANO7	Q6IWH7	933 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	RPAIN	Q86UA6	219 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	YAF2	Q8IY57	180 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	OR8H3	Q8N146	312 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	USP6NL	Q92738	828 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	GLG1	Q92896	1179 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	IWS1	Q96ST2	819 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	FUZ	Q9BT04	418 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CHST8	Q9H2A9	424 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92

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