RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 LHX6Q9UPM6 363 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 V9GYY5 206 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 JCHAINP01591 159 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 APODP05090 189 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 KCNJ1P48048 391 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ARSEP51690 589 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 RHOAP61586 193 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 GPS1Q13098 491 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 SLC45A4Q5BKX6 768 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 SYCE2Q6PIF2 218 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 Q7L0L9 218 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 C14orf80Q86SX3 495 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 MMGT1Q8N4V1 131 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 NAT16Q8N8M0 369 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 PLPP7Q8NBV4 271 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 IFT43Q96FT9 208 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 SPHK2Q9NRA0 654 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 AMACRQ9UHK6 382 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 TRHDEQ9UKU6 1024 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 UQCRHLA0A096LP55 91 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ILVBLA1L0T0 632 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 UQCRHP07919 91 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 FDFT1P37268 417 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 DGKGP49619 791 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 CAV1Q03135 178 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 SLC12A1Q13621 1099 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 GRM2Q14416 872 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 RAB6CQ53S08 254 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 LY6G5CQ5SRR4 150 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 PIK3R6Q5UE93 754 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 GPR153Q6NV75 609 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 NPNTQ6UXI9 565 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 CPXM2Q8N436 756 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC33Q8N5R6 958 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 DNAAF3Q8N9W5 541 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 TTC8Q8TAM2 541 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 GANCQ8TET4 914 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 HTR3CQ8WXA8 447 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 NXPE3Q969Y0 559 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 RAB6CQ9H0N0 254 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 EPB41L5Q9HCM4 733 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 MYH10P35580 1976 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ANK1P16157 1881 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 AP3B1O00203 1094 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ANXA9O76027 345 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 LAMP2P13473 410 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 PGFP49763 221 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 GPS2Q13227 327 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 DMC1Q14565 340 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 NOMO1Q15155 1222 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 SLC5A9Q2M3M2 681 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 BHLHA9Q7RTU4 235 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ATP11CQ8NB49 1132 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 OSCP1Q8WVF1 389 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 SLC22A12Q96S37 553 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC77Q9BR77 488 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 FSD1LQ9BXM9 530 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 SLC2A11Q9BYW1 496 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 DYRK4Q9NR20 520 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM248Q9NWD8 314 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 SNX24Q9Y343 169 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 TIMM44O43615 452 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 LIASO43766 372 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 OPHN1O60890 802 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 IGLV3-25P01717 112 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 CCR2P41597 374 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 GEMP55040 296 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 GBE1Q04446 702 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 SLC20A2Q08357 652 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 DHCR24Q15392 516 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 CASC4Q6P4E1 433 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 JAMLQ86YT9 394 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM121Q9BTD3 319 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 EBF3Q9H4W6 596 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 L2HGDHQ9H9P8 463 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 NT5MQ9NPB1 228 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 RAB6BQ9NRW1 208 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 SAMD15Q9P1V8 674 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 IGSF9Q9P2J2 1179 aa5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms