RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538266.5

SNHG1-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 3 BASIC

Gene SNHG1, Length 347 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-208	ENST00000538266	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CDH9	Q9ULB4	789 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PLAA	Q9Y263	795 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TSC2	P49815	1807 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	HIDE1	A8MVS5	230 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ACOT7	O00154	380 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MAN2B1	O00754	1011 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	GABRD	O14764	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PER2	O15055	1255 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TEX28	O15482	410 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CCP110	O43303	1012 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	NCK2	O43639	380 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	NUAK1	O60285	661 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TUBB4A	P04350	444 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	C8B	P07358	591 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	UCHL3	P15374	230 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CD19	P15391	556 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	FAH	P16930	419 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC9A1	P19634	815 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	NDST1	P52848	882 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CDH8	P55286	799 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC8A3	P57103	927 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ROR1	Q01973	937 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SMARCB1	Q12824	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CAMK1	Q14012	370 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	DUSP6	Q16828	381 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TPGS2	Q68CL5	300 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TMEM270	Q6UE05	265 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	UNC93A	Q86WB7	457 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ELMOD1	Q8N336	334 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	NOX5	Q96PH1	765 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ACBD6	Q9BR61	282 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CISH	Q9NSE2	258 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	VWA8	A3KMH1	1905 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266		F8VZ95	297 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SCD	O00767	359 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ADAM12	O43184	909 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TEX33	O43247	280 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MED7	O43513	233 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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