RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516259.1

RNU6-390P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 390, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-390P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-390P-201ENST00000516259 ABCD1P33897 745 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 IDUAP35475 653 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 GABRB2P47870 512 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SHC2P98077 582 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 RHAGQ02094 409 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 MAMLD1Q13495 774 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 KCTD2Q14681 263 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC18A3Q16572 532 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CCDC30Q5VVM6 783 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SUMO4Q6EEV6 95 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 C17orf99Q6UX52 265 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 NAPRTQ6XQN6 538 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF813Q6ZN06 617 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 RASAL3Q86YV0 1011 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ANKRD52Q8NB46 1076 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SETD9Q8NE22 299 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM170AQ8WVE7 144 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 EPHX3Q9H6B9 360 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SEMA4GQ9NTN9 838 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CDH22Q9UJ99 828 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC25A13Q9UJS0 675 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SARDHQ9UL12 918 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 A0A087X1B8 175 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 OR6C68A6NDL8 312 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 NPIPB8E9PQR5 432 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 TIMM44O43615 452 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 FZD7O75084 574 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 URODP06132 367 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 HOXB5P09067 269 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ALOX12P18054 663 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 TNFRSF1AP19438 455 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 TFEBP19484 476 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 GPD1P21695 349 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 TACR3P29371 465 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 POLD2P49005 469 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 VPS41P49754 854 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 RARSP54136 660 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC12A2P55011 1212 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARF1P84077 181 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SETQ01105 290 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 MST1RQ04912 1400 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC14A1Q13336 389 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 KRT32Q14532 448 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 NAA25Q14CX7 972 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 RPE65Q16518 533 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 MEA1Q16626 185 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 C10orf76Q5T2E6 689 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM69AQ5T7M9 428 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SNX30Q5VWJ9 437 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 RRM2BQ7LG56 351 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 KLBQ86Z14 1044 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CCDC89Q8N998 374 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 C2CD4CQ8TF44 421 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 KAT2BQ92831 832 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CCDC34Q96HJ3 373 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 RITA1Q96K30 269 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 PASKQ96RG2 1323 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 SERINC2Q96SA4 455 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF347Q96SE7 839 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 MAP7D2Q96T17 732 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 EYA3Q99504 573 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 HDHD5Q9BXW7 423 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF341Q9BYN7 854 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CTDSP1Q9GZU7 261 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 LMAN2LQ9H0V9 348 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 CCDC68Q9H2F9 335 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 MROH8Q9H579 483 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 Q9N2J8 555 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 GRHL1Q9NZI5 618 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 HDAC6Q9UBN7 1215 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 ADAM21Q9UKJ8 722 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 TNFSF13BQ9Y275 285 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-390P-201ENST00000516259 WNT6Q9Y6F9 365 aa3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms