RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507186.1

RHOBTB3-208, Transcript of Rho related BTB domain containing 3, human

TSL 3

Gene RHOBTB3, Length 492 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHOBTB3-208	ENST00000507186	GSTM2	P28161	218 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CDH8	P55286	799 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	UBXN2A	P68543	259 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	KRT83	P78385	493 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	FAM189B	P81408	668 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SCML4	Q8N228	414 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	VMP1	Q96GC9	406 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CLGN	O14967	610 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ENTPD3	O75355	529 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	NXPH3	O95157	252 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	NDUFA10	O95299	355 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	GALT	P07902	379 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CHRM2	P08172	466 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CHRM4	P08173	479 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	C1S	P09871	688 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	MUT	P22033	750 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CTGF	P29279	349 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CPOX	P36551	454 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	MTNR1A	P48039	350 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	LMAN1	P49257	510 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	DIO1	P49895	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	AGTR2	P50052	363 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	NXPH1	P58417	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	PRAME	P78395	509 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	TEPSIN	Q96N21	525 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186		A0A1W2PQM1	296 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SUV39H1	O43463	412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	STRN	O43815	780 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ONECUT2	O95948	504 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	C1R	P00736	705 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	RB1	P06400	928 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	IGFBP2	P18065	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	COMT	P21964	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	POU1F1	P28069	291 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	FMO4	P31512	558 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CNR2	P34972	360 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SLC37A1	P57057	533 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	GPC5	P78333	572 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SHC2	P98077	582 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-208	ENST00000507186	PPARD	Q03181	441 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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